More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0264 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  100 
 
 		 290 aa  579  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  96.55 
 
 		 291 aa  563  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1480  cysteine synthase A  63.57 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  58.5 
 
 		 301 aa  324  9e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  58.84 
 
 		 312 aa  318  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.48 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  55.63 
 
 		 310 aa  304  9.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  54.61 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  54.61 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1231  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  58.89 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  61.99 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  58.22 
 
 		 307 aa  295  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  52.7 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  52.36 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  55.67 
 
 		 306 aa  291  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  58.08 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  52.38 
 
 		 304 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  52.41 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  58.56 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  57.88 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  58.22 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  58.22 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  58.22 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  58.22 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  58.22 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  58.22 
 
 		 307 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  57.88 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  57.39 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  54.3 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  53 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  56.27 
 
 		 320 aa  278  6e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  54.92 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  51.71 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  51.38 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  54.95 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  57.34 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  53.56 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  57.19 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  53.26 
 
 		 299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  55 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  51.38 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  50.17 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  49.49 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0464  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.86 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  55.36 
 
 		 300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  56.06 
 
 		 300 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  52.56 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  55.29 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  54.61 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  55.93 
 
 		 308 aa  267  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  51.02 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  49.31 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  53.87 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  55.18 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  54.27 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  49.15 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  56.42 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  55.1 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  50.17 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  54.33 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  51.17 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  49.32 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  51.37 
 
 		 304 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  51.17 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  50.86 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  52.4 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  49.83 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  56.8 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  52.58 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  49.48 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  57.04 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  49.14 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  53.61 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  56.46 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  55.89 
 
 		 309 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  52.15 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  49.48 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  54.76 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  55.78 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  52.88 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  51.2 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  52.86 
 
 		 320 aa  258  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  51.2 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  50.51 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  53.69 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  53.38 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  53.77 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  54.03 
 
 		 308 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  50.5 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  54.79 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  51.35 
 
 		 309 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  51.68 
 
 		 309 aa  255  5e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  48.64 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  50.83 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  53.18 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  53.9 
 
 		 327 aa  254  8e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  53.24 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  52.7 
 
 		 310 aa  254  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  50.17 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>