More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0262 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  89.84 
 
 		 256 aa  481  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  58.04 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0800  TatD family hydrolase  48.02 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  44.05 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  44.44 
 
 		 462 aa  235  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  43.65 
 
 		 606 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  43.03 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  43.43 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  39.76 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  39.84 
 
 		 256 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  42.23 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  42.86 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  42.23 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  41.83 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  41.83 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  39.29 
 
 		 464 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.83 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  39.04 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  41.83 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  42.23 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  41.43 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  42.23 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  41.83 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  40.64 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  40.48 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  41.83 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 256 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  37.45 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  41.27 
 
 		 458 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  39.44 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.48 
 
 		 457 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0934  TatD family hydrolase  40.16 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0016009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  39.13 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  40.48 
 
 		 458 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  39.04 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  38.65 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  37.05 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  42.02 
 
 		 262 aa  207  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.1 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_805  hydrolase, TatD family, Mg-dependent DNase  38.98 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  38.89 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  38.1 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  37.35 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  43.43 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  37.3 
 
 		 461 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  37.85 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  38.25 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  38.4 
 
 		 257 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  40.08 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  38.19 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2068  hydrolase, TatD family  40.24 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  37.3 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1799  hydrolase, TatD family  39.84 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.339563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  37.6 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  37.8 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  38.49 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  38.49 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 259 aa  188  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  37.2 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  40.24 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  38.25 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  39.29 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  38.96 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  37.05 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  36.68 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  37.7 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 264 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  36.9 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0103  TatD family hydrolase  38.08 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0970628  normal  0.125784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  38.28 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0211  TatD family hydrolase  38.43 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  35.97 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  36.55 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0299  putative deoxyribonuclease Sll1786  38.64 
 
 		 256 aa  178  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.858826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0706  TatD family hydrolase  36.65 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  37.4 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  38.1 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  37.7 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  36.6 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0265  hydrolase, TatD family  36.11 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0321314  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0124  TatD family hydrolase  36.78 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  33.98 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  38.13 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  36.65 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02785  Sec-independent protein translocase protein TatD  37.65 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  36.72 
 
 		 265 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  39.91 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  38.19 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.06 
 
 		 459 aa  173  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  35.6 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  35.91 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1227  hydrolase, TatD family  36.9 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  35.46 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  38.82 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  33.73 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>