More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0187 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
635 aa  730  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
643 aa  658  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
646 aa  642  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
636 aa  669  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 
633 aa  748  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 
639 aa  738  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
638 aa  642  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
640 aa  733  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
639 aa  738  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
644 aa  671  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
645 aa  672  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 
644 aa  635  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
638 aa  682  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 
640 aa  727  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
639 aa  741  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
636 aa  668  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
636 aa  694  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.92835e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
640 aa  1318  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
635 aa  720  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
640 aa  636  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
645 aa  671  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  99.22 
 
 
640 aa  1311  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
644 aa  641  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 
640 aa  723  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
636 aa  656  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 
638 aa  910  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
644 aa  647  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  58.19 
 
 
635 aa  760  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
635 aa  732  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
637 aa  648  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
584 aa  637  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 
640 aa  835  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
639 aa  734  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 
634 aa  732  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 
639 aa  710  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
662 aa  662  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
644 aa  636  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
639 aa  741  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
636 aa  657  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
643 aa  666  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.77582e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
638 aa  676  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
639 aa  738  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 
637 aa  647  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67344e-05 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 
634 aa  738  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
633 aa  647  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 
631 aa  703  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.76694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
649 aa  642  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
634 aa  655  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 
637 aa  728  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 
640 aa  738  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
652 aa  639  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  55.4 
 
 
639 aa  735  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 
635 aa  692  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.83369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
643 aa  646  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
644 aa  639  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.86283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  66.98 
 
 
636 aa  908  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
640 aa  676  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
644 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
638 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
644 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
648 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
635 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
635 aa  628  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
647 aa  628  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1760  threonyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
642 aa  625  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000746645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
642 aa  624  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
644 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  9.9925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
639 aa  623  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
642 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
647 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
641 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
635 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
635 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
635 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 
643 aa  616  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
640 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
648 aa  617  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
635 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 
588 aa  615  1e-175  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
638 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 
635 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
635 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.01 
 
 
638 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 
646 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.88041e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
635 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1937  threonyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 
642 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.27542e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0870  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
635 aa  611  1e-173  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
642 aa  611  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
635 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>