241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0099 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0099  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  652  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0099  ribokinase-like domain-containing protein  96.24 
 
 
319 aa  632  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0182  ribokinase-like domain-containing protein  44.65 
 
 
320 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0676  ribokinase-like domain-containing protein  46.39 
 
 
317 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0971  ribokinase-like domain-containing protein  39.5 
 
 
318 aa  225  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 
310 aa  173  4e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2297  1-phosphofructokinase  33.46 
 
 
319 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  31.25 
 
 
310 aa  135  6e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  31.62 
 
 
303 aa  129  5e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.09 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  32.72 
 
 
303 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.76 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.99 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.70139e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  30.35 
 
 
306 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  32.1 
 
 
303 aa  121  1e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.25 
 
 
303 aa  122  1e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
308 aa  121  2e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.63995e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 
303 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 
303 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 
303 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54533e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.99 
 
 
315 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.10184e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.75 
 
 
303 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.02 
 
 
303 aa  120  4e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  27.48 
 
 
310 aa  120  4e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  27.48 
 
 
310 aa  120  4e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 
303 aa  120  4e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  30 
 
 
308 aa  119  5e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  6.7569e-09 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  30.07 
 
 
324 aa  119  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  30.48 
 
 
313 aa  118  1e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  31.72 
 
 
311 aa  117  2e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  31.55 
 
 
325 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 
314 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.02 
 
 
315 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  28.7 
 
 
318 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 
310 aa  115  7e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  28.12 
 
 
318 aa  115  1e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.85 
 
 
306 aa  114  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.85 
 
 
306 aa  114  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  29.9 
 
 
320 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.26 
 
 
307 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  26.56 
 
 
310 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.36585e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6208  1-phosphofructokinase  30.48 
 
 
312 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  27.33 
 
 
307 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 
312 aa  111  2e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.19 
 
 
305 aa  111  2e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0866  1-phosphofructokinase  28.9 
 
 
310 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00871601  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  28.53 
 
 
310 aa  110  4e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  27.78 
 
 
305 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  28.06 
 
 
316 aa  109  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  31.43 
 
 
300 aa  109  7e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.28039e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  28.99 
 
 
310 aa  109  8e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  28.12 
 
 
307 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  34.2 
 
 
310 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31 
 
 
304 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  28.48 
 
 
310 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.71 
 
 
311 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  28.77 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  27.91 
 
 
310 aa  106  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  28.71 
 
 
306 aa  105  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  26.42 
 
 
308 aa  106  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.96 
 
 
311 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  26.73 
 
 
323 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  29.09 
 
 
314 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  27.4 
 
 
311 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  26.46 
 
 
317 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  27.9 
 
 
326 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  27.9 
 
 
330 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  28.72 
 
 
308 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 
332 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  28.62 
 
 
311 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  29.74 
 
 
322 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  28.3 
 
 
311 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 
336 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  31.97 
 
 
313 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  25.85 
 
 
318 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0661  1-phosphofructokinase  27.05 
 
 
314 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0132953  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  26.67 
 
 
325 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  29.66 
 
 
310 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 
312 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 
312 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  4.93552e-06 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  26.84 
 
 
324 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 
312 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 
312 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.49505e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  30.18 
 
 
312 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  28.67 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  29.43 
 
 
313 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  28.09 
 
 
302 aa  99  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  26.71 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.43379e-07  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.77642e-05  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  1.4871e-08 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  29.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.69227e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.19891e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  29.82 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.12726e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  30.32 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  32.13 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  27.92 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  28.48 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>