More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0096 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0096  aminotransferase class IV  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.609842  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0096  aminotransferase, class IV  90.48 
 
 
273 aa  512  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.198329  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0968  aminotransferase class IV  44.07 
 
 
249 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0673  aminotransferase, class IV  41.77 
 
 
247 aa  165  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  38.27 
 
 
271 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0248  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 
305 aa  134  2e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  34.07 
 
 
298 aa  118  1e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
311 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  30.96 
 
 
293 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0782  branched-chain amino acid aminotransferase  33.6 
 
 
322 aa  113  4e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  30.2 
 
 
309 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1228  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 
302 aa  111  1e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  6.31212e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1366  branched-chain amino acid aminotransferase  32.14 
 
 
305 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1720  branched-chain amino acid aminotransferase  29.43 
 
 
316 aa  110  4e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  32.73 
 
 
320 aa  110  4e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  29.54 
 
 
303 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
304 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  30.54 
 
 
309 aa  108  8e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4800  branched-chain amino acid aminotransferase  38.89 
 
 
304 aa  108  9e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  31.93 
 
 
297 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  32.95 
 
 
307 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  30.2 
 
 
309 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 
304 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  30.27 
 
 
303 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  32.75 
 
 
305 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  32.2 
 
 
307 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  29.87 
 
 
309 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  29.87 
 
 
309 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  29.87 
 
 
309 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  29.87 
 
 
309 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  31.47 
 
 
299 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 
299 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 
299 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0009  branched-chain amino acid aminotransferase  34.78 
 
 
306 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  33.21 
 
 
304 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  32.86 
 
 
304 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.08 
 
 
299 aa  104  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 
292 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.97 
 
 
290 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  28.93 
 
 
288 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 
289 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  32.2 
 
 
307 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 
282 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 
287 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  29.19 
 
 
308 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  29.19 
 
 
308 aa  102  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  29.19 
 
 
308 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  27.5 
 
 
286 aa  102  8e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  31.71 
 
 
306 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 
287 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 
317 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1029  branched-chain amino acid aminotransferase  35.85 
 
 
304 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 
299 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 
308 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_9  branched-chain amino acid aminotransferase  33.9 
 
 
306 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.8 
 
 
290 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  30.53 
 
 
309 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.36 
 
 
307 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1122  branched-chain amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
304 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0347625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  35.14 
 
 
307 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 
339 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.36 
 
 
290 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.03 
 
 
290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  35.43 
 
 
304 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.03 
 
 
290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28474e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  28.98 
 
 
293 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.54665e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.03 
 
 
290 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 
308 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0009  branched-chain amino acid aminotransferase  33.9 
 
 
306 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
307 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  26.74 
 
 
287 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 
288 aa  99.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  30.37 
 
 
309 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  4.01768e-05 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.96 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.69 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.69 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.45 
 
 
290 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2479  branched-chain amino acid aminotransferase  32.06 
 
 
310 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  28.11 
 
 
292 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  29.19 
 
 
308 aa  99  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 
308 aa  99  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2033  branched-chain amino acid aminotransferase  33.2 
 
 
304 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3033  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
317 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0183291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>