More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0094 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 
659 aa  667  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  50.7 
 
 
645 aa  644  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  53.51 
 
 
649 aa  652  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  53.28 
 
 
665 aa  647  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  53.47 
 
 
640 aa  642  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  98.9 
 
 
636 aa  1281  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  3.63706e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  52.25 
 
 
686 aa  664  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  54.15 
 
 
641 aa  678  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  53.62 
 
 
642 aa  688  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  53.47 
 
 
640 aa  642  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  53.28 
 
 
663 aa  647  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  54.16 
 
 
633 aa  691  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  54.08 
 
 
637 aa  682  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  52.82 
 
 
654 aa  652  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1311  DNA gyrase subunit B  56.52 
 
 
641 aa  670  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  65.78 
 
 
650 aa  838  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  54.63 
 
 
648 aa  672  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  55.59 
 
 
645 aa  696  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  51.89 
 
 
654 aa  644  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.27299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  56.51 
 
 
640 aa  684  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  53.36 
 
 
646 aa  660  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.94 
 
 
647 aa  660  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  53.23 
 
 
719 aa  646  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  54.64 
 
 
655 aa  673  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  55.47 
 
 
655 aa  695  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  54.75 
 
 
655 aa  673  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  57.75 
 
 
640 aa  707  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  54.63 
 
 
645 aa  671  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  55.16 
 
 
643 aa  700  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  58 
 
 
649 aa  741  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.2 
 
 
628 aa  762  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  54.5 
 
 
655 aa  666  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  60.44 
 
 
636 aa  734  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  53.11 
 
 
651 aa  678  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  56.36 
 
 
638 aa  706  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  53.06 
 
 
648 aa  671  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  4.66462e-07  hitchhiker  9.32752e-07 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  54.91 
 
 
655 aa  678  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  56.92 
 
 
637 aa  695  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.64 
 
 
653 aa  654  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  56.29 
 
 
635 aa  694  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 
656 aa  687  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  58.41 
 
 
641 aa  727  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  54.24 
 
 
650 aa  658  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  53.22 
 
 
636 aa  674  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  59.81 
 
 
635 aa  749  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  649  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  4.39989e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 
640 aa  673  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  51.4 
 
 
650 aa  657  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  56.09 
 
 
642 aa  717  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  57.61 
 
 
642 aa  717  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  56.99 
 
 
637 aa  733  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  51.87 
 
 
665 aa  691  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  57.32 
 
 
645 aa  674  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  56.04 
 
 
640 aa  677  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.5 
 
 
654 aa  642  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.39 
 
 
638 aa  635  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.29732e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  56.6 
 
 
644 aa  714  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.81 
 
 
654 aa  648  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 
640 aa  673  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  56.51 
 
 
640 aa  680  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  51.34 
 
 
654 aa  641  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  9.67673e-06  decreased coverage  6.94445e-13 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  53.05 
 
 
634 aa  649  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  56.52 
 
 
641 aa  670  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  51.93 
 
 
645 aa  643  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  55.49 
 
 
650 aa  733  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.73734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  55.47 
 
 
649 aa  703  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0006  DNA gyrase, B subunit  51.6 
 
 
657 aa  637  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  56.99 
 
 
635 aa  696  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  58.33 
 
 
633 aa  735  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  6.95632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  51.57 
 
 
654 aa  644  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  55.73 
 
 
640 aa  671  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  59.43 
 
 
641 aa  773  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 
642 aa  660  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  54.93 
 
 
658 aa  665  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
636 aa  1292  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  52.88 
 
 
652 aa  645  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  52.26 
 
 
651 aa  660  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  56.25 
 
 
644 aa  721  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  1.55334e-06 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  51.56 
 
 
647 aa  652  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  54.67 
 
 
644 aa  704  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.08 
 
 
651 aa  674  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  55.14 
 
 
643 aa  701  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  56.27 
 
 
640 aa  730  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  58.56 
 
 
640 aa  708  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  54.8 
 
 
656 aa  667  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.00667e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  52.92 
 
 
648 aa  646  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47413e-07 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  54.69 
 
 
637 aa  704  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  55.49 
 
 
637 aa  724  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.81 
 
 
654 aa  648  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 
675 aa  700  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  52.7 
 
 
644 aa  656  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  52.04 
 
 
654 aa  649  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  56.2 
 
 
640 aa  677  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  54.43 
 
 
647 aa  635  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  56.9 
 
 
632 aa  733  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  50.7 
 
 
635 aa  638  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  53.93 
 
 
642 aa  696  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  58.75 
 
 
640 aa  738  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.81 
 
 
654 aa  648  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.3182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  55.57 
 
 
640 aa  673  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>