81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0086 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
456 aa  914  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  99.34 
 
 
456 aa  909  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  32.61 
 
 
684 aa  232  8e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  30.23 
 
 
409 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  28.5 
 
 
412 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  36.24 
 
 
435 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  32.45 
 
 
416 aa  148  2e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  29.51 
 
 
426 aa  140  5e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  31.38 
 
 
460 aa  115  1e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  25.84 
 
 
341 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  28.95 
 
 
613 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  26.88 
 
 
600 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  29.2 
 
 
497 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3019  hypothetical protein  33.75 
 
 
311 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  33.09 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  29.46 
 
 
561 aa  93.2  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  28.12 
 
 
436 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1316  S-layer-like protein array-related protein  32.32 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  33.33 
 
 
533 aa  90.1  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  28.81 
 
 
660 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  30.58 
 
 
546 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 
750 aa  82.8  1e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
752 aa  79.3  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  32 
 
 
335 aa  78.2  3e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  27.2 
 
 
727 aa  77.4  5e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0720  hypothetical protein  26.82 
 
 
287 aa  75.5  2e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  26.34 
 
 
553 aa  74.3  4e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1560  S-layer-like protein array-related protein  26.97 
 
 
303 aa  73.6  7e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.39656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  36.36 
 
 
1096 aa  68.9  2e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  36.18 
 
 
326 aa  67.4  5e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  7.10587e-05 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0391  S-layer-like protein array-related protein  25.61 
 
 
196 aa  67.4  5e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0608317  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.76 
 
 
1085 aa  67  7e-10  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  35.35 
 
 
652 aa  66.2  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
642 aa  63.5  7e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  28.97 
 
 
219 aa  63.2  9e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  33.11 
 
 
412 aa  63.2  1e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 
601 aa  62.4  2e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  28.76 
 
 
592 aa  59.7  1e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  28.06 
 
 
963 aa  58.5  3e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1609  S-layer-like protein array-related protein-like protein  26.04 
 
 
472 aa  54.3  5e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  29.02 
 
 
311 aa  54.3  5e-06  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 
930 aa  53.5  8e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 
769 aa  53.1  9e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2071  hypothetical protein  28.28 
 
 
296 aa  52.4  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.686043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  32.12 
 
 
465 aa  52  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  1.70724e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  40.28 
 
 
374 aa  52.4  2e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1548  hypothetical protein  25.17 
 
 
300 aa  51.6  3e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  26.23 
 
 
269 aa  51.2  4e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3740  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 
591 aa  51.2  4e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.293383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3881  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 
593 aa  50.4  6e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.154001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3797  serine/threonine protein kinase  31.2 
 
 
593 aa  50.4  6e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.059724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0204  hypothetical protein  26.42 
 
 
285 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  43.1 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2901  hypothetical protein  32.39 
 
 
274 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000575173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 
996 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  26.74 
 
 
1189 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0202  hypothetical protein  27.06 
 
 
285 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0300884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3789  PEGA domain protein  37.7 
 
 
338 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  52.38 
 
 
317 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2383  hypothetical protein  27.27 
 
 
293 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0932192 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0261  PEGA domain-containing protein  32.84 
 
 
266 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00732448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0552  hypothetical protein  33.06 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.092492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1640  PEGA domain-containing protein  31.82 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  37.1 
 
 
211 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0079  PEGA domain-containing protein  29.31 
 
 
247 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  30.11 
 
 
276 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  38.55 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0524  hypothetical protein  32.23 
 
 
463 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.195293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4011  PEGA domain protein  36.11 
 
 
438 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0496099  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5102  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
629 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0992  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
774 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2665  PEGA domain-containing protein  26.79 
 
 
267 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0167  hypothetical protein  39.44 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  2.40644e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3377  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 
586 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  31.58 
 
 
843 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  38.89 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  23.74 
 
 
1122 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0262  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
806 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297751  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3706  PEGA domain protein  35 
 
 
338 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  32.35 
 
 
271 aa  43.1  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  40.58 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>