252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0081 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  100 
 
 
132 aa  268  3e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  3.94049e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  93.94 
 
 
132 aa  253  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  4.36242e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  60 
 
 
128 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  56.45 
 
 
142 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  55.91 
 
 
131 aa  152  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  59.02 
 
 
129 aa  151  3e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  55.3 
 
 
132 aa  149  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  57.85 
 
 
126 aa  146  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  56.56 
 
 
133 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  57.98 
 
 
131 aa  142  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  53.33 
 
 
137 aa  139  1e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  55.28 
 
 
138 aa  137  4e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  52.5 
 
 
138 aa  137  5e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  52 
 
 
132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.01486e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  52 
 
 
132 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  52 
 
 
132 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.26639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  53.28 
 
 
132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  52 
 
 
132 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  52.42 
 
 
135 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  52 
 
 
132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  52 
 
 
132 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0025  cytidine deaminase  52.67 
 
 
134 aa  134  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  52.89 
 
 
127 aa  134  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  51.2 
 
 
132 aa  133  1e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  51.2 
 
 
132 aa  133  1e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  57.6 
 
 
129 aa  132  2e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  51.2 
 
 
132 aa  132  2e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  52.07 
 
 
127 aa  131  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  50.41 
 
 
159 aa  130  4e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  51.24 
 
 
132 aa  130  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  50.82 
 
 
132 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  50.39 
 
 
138 aa  129  2e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  52.03 
 
 
388 aa  128  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  57.5 
 
 
136 aa  126  1e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  56.56 
 
 
301 aa  126  1e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  53.23 
 
 
129 aa  125  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  49.61 
 
 
131 aa  125  2e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  7.92295e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  49.61 
 
 
131 aa  125  2e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  8.7188e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  49.61 
 
 
131 aa  125  2e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04883e-15 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  50.4 
 
 
131 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  3.55072e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  49.22 
 
 
131 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.37931e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  45.6 
 
 
135 aa  124  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  50.4 
 
 
131 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  50.4 
 
 
131 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.38736e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  50.4 
 
 
131 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.61998e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  50.4 
 
 
131 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  50.4 
 
 
131 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.41202e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  48.41 
 
 
131 aa  124  4e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  50 
 
 
132 aa  124  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  49.18 
 
 
135 aa  124  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  48.82 
 
 
131 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  47.66 
 
 
142 aa  123  8e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  52.89 
 
 
130 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  6.42957e-08 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  48.8 
 
 
149 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  49.58 
 
 
151 aa  121  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  51.61 
 
 
132 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  50.41 
 
 
139 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  50.81 
 
 
132 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  48.03 
 
 
175 aa  119  2e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  48.65 
 
 
136 aa  118  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0740  cytidine deaminase  49.19 
 
 
130 aa  117  5e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  49.59 
 
 
129 aa  116  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  46.51 
 
 
138 aa  115  2e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6241  cytidine deaminase  46.03 
 
 
129 aa  115  2e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.217338  normal  0.894039 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1590  cytidine deaminase, homotetrameric  46.03 
 
 
129 aa  115  2e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.672305  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6717  cytidine deaminase  46.03 
 
 
129 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  43.55 
 
 
129 aa  114  4e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  50 
 
 
125 aa  114  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  42.28 
 
 
133 aa  113  9e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  45.79 
 
 
137 aa  113  1e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0741  cytidine deaminase  45.74 
 
 
129 aa  112  2e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.605796  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  46.28 
 
 
136 aa  112  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6091  cytidine deaminase  45.67 
 
 
143 aa  112  2e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1065  cytidine deaminase  47.15 
 
 
135 aa  110  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.805536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  49.11 
 
 
135 aa  110  7e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4421  cytidine deaminase  44.96 
 
 
129 aa  109  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1528  cytidine deaminase  42.52 
 
 
130 aa  109  1e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0644622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1838  cytidine deaminase  44.27 
 
 
144 aa  109  2e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2661  hypothetical protein  49.54 
 
 
231 aa  108  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0413  cytidine deaminase  50.46 
 
 
130 aa  108  2e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1065  cytidine deaminase  49.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1279  cytidine deaminase  49.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910001  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2803  cytidine deaminase  49.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.33392  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0115  cytidine deaminase  49.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0139  cytidine deaminase  49.54 
 
 
130 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  46.22 
 
 
129 aa  107  4e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  52.68 
 
 
135 aa  107  7e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0146  cytidine deaminase  43.51 
 
 
181 aa  106  9e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1626  cytidine deaminase  43.97 
 
 
134 aa  106  9e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1660  cytidine deaminase  43.97 
 
 
134 aa  106  9e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  44.26 
 
 
139 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1135  cytidine deaminase  44.83 
 
 
134 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0737  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  51.79 
 
 
582 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6661  cytidine deaminase  48.62 
 
 
129 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872827  normal  0.0420856 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  45.76 
 
 
133 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  39.02 
 
 
157 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  42.97 
 
 
138 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1469  cytidine deaminase  44.34 
 
 
136 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0427929  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  41.32 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  42.98 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>