More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0080 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  100 
 
 
301 aa  607  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  98.33 
 
 
300 aa  597  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  66.11 
 
 
299 aa  413  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  63.46 
 
 
301 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  61.94 
 
 
306 aa  368  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  52.36 
 
 
302 aa  308  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 
301 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
301 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
301 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  52.84 
 
 
302 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 
301 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  50 
 
 
298 aa  295  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  50 
 
 
302 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  48.99 
 
 
300 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  49.15 
 
 
300 aa  292  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  48.31 
 
 
303 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  50.7 
 
 
293 aa  285  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  47.59 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  51.38 
 
 
294 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  48.78 
 
 
299 aa  275  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  48.78 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  46.39 
 
 
297 aa  271  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  46.51 
 
 
299 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  46.51 
 
 
299 aa  271  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 
308 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  47.77 
 
 
303 aa  269  5e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  47.18 
 
 
303 aa  268  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  50.35 
 
 
300 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  44.67 
 
 
299 aa  263  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  46.81 
 
 
296 aa  263  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 
305 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 
298 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
297 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
297 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
298 aa  257  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  45.96 
 
 
303 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 
296 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  47.67 
 
 
298 aa  255  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  47.46 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 
318 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  45.27 
 
 
337 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
297 aa  252  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
296 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
296 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.54 
 
 
451 aa  249  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
299 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  45.33 
 
 
302 aa  248  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  44.74 
 
 
303 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  47.89 
 
 
449 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  47.72 
 
 
489 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  45.7 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  47.97 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  46.38 
 
 
301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  45.42 
 
 
307 aa  243  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  44.56 
 
 
314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  43.82 
 
 
315 aa  241  9e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 
315 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
313 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  43.99 
 
 
303 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  42.43 
 
 
303 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  45.08 
 
 
313 aa  238  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 
324 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  42.66 
 
 
303 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  44.48 
 
 
468 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 
303 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  42.36 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 
303 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  44.33 
 
 
312 aa  231  8.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  44.76 
 
 
293 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 
319 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  41.58 
 
 
312 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2851  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
300 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 
343 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
293 aa  225  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0251  GTP-binding protein Era  42.41 
 
 
311 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  43.8 
 
 
293 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  43.15 
 
 
297 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 
308 aa  222  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  42 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  42.76 
 
 
314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  42.52 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1212  GTP-binding protein Era  40.82 
 
 
297 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  41.08 
 
 
301 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  42.32 
 
 
318 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6543  GTP-binding protein Era  42.71 
 
 
289 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2652  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 
307 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0337857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  43.37 
 
 
305 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>