93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0079 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  93.94 
 
 
363 aa  705  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.12587e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
363 aa  738  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  46.43 
 
 
376 aa  352  5e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  47.8 
 
 
357 aa  350  3e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  37.98 
 
 
365 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.46 
 
 
379 aa  277  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  34.77 
 
 
369 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  34.59 
 
 
375 aa  215  1e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  8.96118e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  32.61 
 
 
366 aa  213  5e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  35.04 
 
 
366 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  35.04 
 
 
366 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  34.14 
 
 
370 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.78 
 
 
391 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  34.23 
 
 
372 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  33.96 
 
 
372 aa  201  1e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  32.08 
 
 
379 aa  197  2e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  31.74 
 
 
396 aa  196  4e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  33.16 
 
 
368 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  32.44 
 
 
368 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  32.44 
 
 
368 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  33.24 
 
 
369 aa  192  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.43151e-07  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  32.89 
 
 
368 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  32.39 
 
 
401 aa  184  2e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  30.29 
 
 
368 aa  184  2e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  30.03 
 
 
385 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  30 
 
 
365 aa  147  2e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  27.32 
 
 
710 aa  141  2e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  26.03 
 
 
604 aa  134  2e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  24.8 
 
 
367 aa  135  2e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.63 
 
 
361 aa  113  4e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  24.68 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 
717 aa  63.9  4e-09  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  29.08 
 
 
259 aa  58.2  2e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  28.74 
 
 
560 aa  57  5e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  29.31 
 
 
534 aa  56.6  6e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  32.35 
 
 
268 aa  53.1  7e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.56 
 
 
285 aa  53.1  8e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  31.06 
 
 
258 aa  52.4  1e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  30.95 
 
 
261 aa  52.4  1e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  27.13 
 
 
521 aa  51.6  2e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  32.39 
 
 
261 aa  50.8  4e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.81 
 
 
298 aa  50.4  4e-05  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  33.09 
 
 
260 aa  50.4  4e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.75 
 
 
271 aa  50.1  6e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  25.79 
 
 
360 aa  49.7  8e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  27.62 
 
 
562 aa  49.7  9e-05  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  27.87 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.07031e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  26.15 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  26.15 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  28.4 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  31.45 
 
 
379 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  26.84 
 
 
544 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  31.37 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  30.99 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  28.42 
 
 
443 aa  47.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  33.77 
 
 
374 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0737  GTP-binding protein EngA  27.37 
 
 
440 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  33.12 
 
 
384 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  31.06 
 
 
441 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  31.37 
 
 
388 aa  46.6  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  28.26 
 
 
316 aa  46.6  0.0007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  28.75 
 
 
449 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  28.03 
 
 
439 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  32.77 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  32.77 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  27.37 
 
 
440 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  27.33 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  25.93 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  35.34 
 
 
460 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  48.21 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  27.36 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 
462 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  29.19 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  35.63 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  28.21 
 
 
473 aa  44.3  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  35.35 
 
 
431 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  23.21 
 
 
281 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  26.95 
 
 
277 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.52633e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  27.44 
 
 
281 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  33.62 
 
 
302 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.0527e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  27.59 
 
 
443 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  22.73 
 
 
669 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  30.25 
 
 
444 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  28.24 
 
 
452 aa  43.1  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  24.4 
 
 
281 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  42.86 
 
 
328 aa  42.7  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0372  GTP-binding protein Era  43.75 
 
 
297 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0680727  normal  0.750756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>