More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0077 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  100 
 
 
172 aa  329  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  97.09 
 
 
172 aa  318  2e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  7.49846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0088  GrpE protein  45.81 
 
 
183 aa  132  2e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.141966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1243  GrpE protein  47.17 
 
 
194 aa  129  2e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.847683  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  47.83 
 
 
194 aa  124  4e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  46.67 
 
 
192 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  44.83 
 
 
210 aa  119  2e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  41.61 
 
 
213 aa  113  1e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.30249e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  43.92 
 
 
231 aa  110  1e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  43.71 
 
 
207 aa  109  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  42.21 
 
 
225 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  42.36 
 
 
174 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  38.51 
 
 
198 aa  104  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  42.76 
 
 
178 aa  104  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40 
 
 
195 aa  104  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  38.71 
 
 
192 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.07397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  35.54 
 
 
282 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  40.41 
 
 
213 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  38.93 
 
 
192 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  38.12 
 
 
206 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.14529e-07  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  42.86 
 
 
204 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.98101e-09  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  36.54 
 
 
208 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.29 
 
 
243 aa  100  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.56 
 
 
208 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  39.44 
 
 
191 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  40 
 
 
238 aa  99.4  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  39.35 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  39.23 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
224 aa  99  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0564  GrpE protein  33.33 
 
 
211 aa  98.6  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
225 aa  98.2  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1824  GrpE protein  35.44 
 
 
234 aa  98.2  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.311455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  39.53 
 
 
189 aa  97.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
237 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  36.47 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  37.01 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  41.56 
 
 
206 aa  95.5  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  35.95 
 
 
189 aa  95.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  35.62 
 
 
203 aa  94.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  40 
 
 
201 aa  94.4  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
247 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  40.77 
 
 
186 aa  94  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 
199 aa  94  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.13319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  38.36 
 
 
178 aa  94  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.67 
 
 
190 aa  94  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  35.95 
 
 
267 aa  93.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  36.42 
 
 
181 aa  94  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00660  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.73 
 
 
248 aa  92.8  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.204562  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  39.01 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  35.1 
 
 
217 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  35.77 
 
 
198 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  38.36 
 
 
226 aa  92.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.05 
 
 
189 aa  92  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.61 
 
 
239 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  37.58 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.24 
 
 
201 aa  91.3  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  38 
 
 
204 aa  90.9  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  40.43 
 
 
189 aa  90.9  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  33.77 
 
 
172 aa  90.5  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  39.74 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  35.66 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  37.68 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  36.63 
 
 
261 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  40.27 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  37.14 
 
 
193 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  36.63 
 
 
261 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  37.11 
 
 
199 aa  89  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  35.48 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  36.36 
 
 
179 aa  89  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  34.12 
 
 
245 aa  88.6  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  39.53 
 
 
202 aa  88.6  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  35.67 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  37.42 
 
 
204 aa  87.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  36.42 
 
 
205 aa  87.8  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  31.97 
 
 
239 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 
259 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  34.46 
 
 
299 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  33.78 
 
 
265 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 
248 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.36 
 
 
200 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  31.79 
 
 
259 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  37.88 
 
 
205 aa  86.3  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  36.91 
 
 
224 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  34.87 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  34.87 
 
 
223 aa  85.1  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  38.56 
 
 
286 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  34.33 
 
 
274 aa  85.1  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>