248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0076 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
338 aa  674  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  95.86 
 
 
338 aa  654  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  6.66316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1242  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.07 
 
 
340 aa  249  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0655276  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0089  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.32 
 
 
337 aa  239  7e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000627651  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.73 
 
 
335 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.79 
 
 
337 aa  134  2e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  31.07 
 
 
343 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.39 
 
 
337 aa  127  2e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.49 
 
 
340 aa  126  4e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.41 
 
 
343 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.53808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.84 
 
 
344 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  27.93 
 
 
339 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  27.54 
 
 
339 aa  122  1e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.96 
 
 
345 aa  122  1e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  28.89 
 
 
339 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  31.69 
 
 
364 aa  120  4e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.46 
 
 
346 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.94 
 
 
345 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.36 
 
 
343 aa  118  1e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.34 
 
 
343 aa  117  4e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.44 
 
 
351 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  28.97 
 
 
351 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.8 
 
 
344 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  28.57 
 
 
370 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  26.33 
 
 
344 aa  115  1e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.89 
 
 
343 aa  114  2e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.76294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  28.57 
 
 
340 aa  114  2e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.6 
 
 
363 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  25.75 
 
 
344 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.3 
 
 
337 aa  113  4e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  25.77 
 
 
343 aa  113  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  29.68 
 
 
339 aa  112  1e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  30.13 
 
 
343 aa  112  1e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.48 
 
 
347 aa  111  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.96344e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  26.17 
 
 
338 aa  110  2e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  29.25 
 
 
341 aa  111  2e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.36 
 
 
352 aa  111  2e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  27.08 
 
 
338 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.36482e-07  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  25.55 
 
 
338 aa  110  4e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  26.77 
 
 
338 aa  110  4e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  28.23 
 
 
365 aa  110  4e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  26.17 
 
 
338 aa  110  4e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.94366e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  26.81 
 
 
343 aa  110  4e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  28.21 
 
 
343 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  26.17 
 
 
338 aa  109  7e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  25.86 
 
 
338 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.07 
 
 
348 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  25.86 
 
 
338 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.37715e-32 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  27.03 
 
 
348 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.61 
 
 
365 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  28.61 
 
 
360 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  27.4 
 
 
357 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  30.29 
 
 
336 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  25.86 
 
 
338 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  28.52 
 
 
339 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  25.86 
 
 
338 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.1 
 
 
339 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.52 
 
 
336 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.69 
 
 
340 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  26.3 
 
 
347 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  26.3 
 
 
347 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  26.3 
 
 
347 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.19 
 
 
351 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.82 
 
 
351 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.26 
 
 
346 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.33 
 
 
340 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.91 
 
 
340 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  28.52 
 
 
340 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  34.38 
 
 
354 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.48 
 
 
355 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 
341 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
339 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  28.81 
 
 
366 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.36 
 
 
345 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  5.295e-05  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  27.53 
 
 
349 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  26.02 
 
 
343 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.67 
 
 
340 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0604  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.87 
 
 
343 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  24.34 
 
 
352 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  7.04325e-06  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  27.09 
 
 
337 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.69 
 
 
350 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  26.52 
 
 
353 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.7 
 
 
350 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.9 
 
 
350 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.39 
 
 
354 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2873  heat-inducible transcription repressor  28.62 
 
 
354 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.8 
 
 
344 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.63 
 
 
348 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.06 
 
 
347 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.27 
 
 
344 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.62 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  28.92 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.35 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  28.7 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.05 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.78 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  27.17 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2944  heat-inducible transcription repressor  27.61 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2324  heat-inducible transcription repressor  31.11 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>