More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0070 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0070  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.45223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0070  riboflavin biosynthesis protein RibF  93.52 
 
 
293 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0398  riboflavin biosynthesis protein RibF  49.65 
 
 
289 aa  270  3e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00802813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0437  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.1 
 
 
292 aa  234  1e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.358638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1693  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.86 
 
 
296 aa  182  8e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0492  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.05 
 
 
315 aa  172  7e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.196365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1439  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.51 
 
 
325 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.88 
 
 
316 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0579  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.59 
 
 
310 aa  165  7e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0112657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
312 aa  164  2e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0480  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.74 
 
 
355 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0923  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.63 
 
 
311 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.91 
 
 
310 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1290  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.49 
 
 
311 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  8.0021e-06  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1650  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.21 
 
 
296 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2384  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.49 
 
 
311 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1412  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.56 
 
 
315 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1061  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.11 
 
 
317 aa  157  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.76 
 
 
311 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1193  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.13 
 
 
311 aa  156  5e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  2.37633e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00979  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.62 
 
 
311 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004420  riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.06 
 
 
294 aa  155  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0885612  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0583  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.49 
 
 
309 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1654  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.21 
 
 
309 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.84 
 
 
311 aa  155  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.71 
 
 
309 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.93 
 
 
312 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1055  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.76 
 
 
305 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.43008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60380  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.93 
 
 
312 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.78317e-05 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1936  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.76 
 
 
309 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4028  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.29 
 
 
338 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.33 
 
 
313 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.21 
 
 
311 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0805  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.93 
 
 
308 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  34.72 
 
 
306 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.14 
 
 
308 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0709  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.93 
 
 
314 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  35.59 
 
 
307 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.15 
 
 
314 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3260  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  32.99 
 
 
307 aa  152  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.853112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1776  riboflavin kinase / FAD synthetase  35.03 
 
 
320 aa  152  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.143306  normal  0.170251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.57 
 
 
312 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4560  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.43 
 
 
316 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.270493  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0952  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.35 
 
 
316 aa  152  9e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.431648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0808  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.74 
 
 
331 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.23 
 
 
328 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0213  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.21 
 
 
322 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.27135e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.39 
 
 
306 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1053  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.57 
 
 
311 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0005449  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1155  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.57 
 
 
311 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00349764  normal  0.220193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0987  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  35.47 
 
 
312 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.74 
 
 
308 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3533  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.25 
 
 
311 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  36.39 
 
 
306 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  35.91 
 
 
310 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.15 
 
 
309 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.39 
 
 
306 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.71 
 
 
311 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0575  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  36.03 
 
 
330 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.13057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1120  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.57 
 
 
311 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.101857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.55 
 
 
325 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3236  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.57 
 
 
311 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.440094  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0759  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.68 
 
 
310 aa  150  3e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.776079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0643  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  39.01 
 
 
322 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3158  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.74 
 
 
331 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0387095  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.32 
 
 
319 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0947  bifunctional protein: riboflavin kinase; FAD synthetase  33.11 
 
 
309 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0648  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.72 
 
 
322 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0693294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2770  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.45 
 
 
317 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.31 
 
 
311 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.68 
 
 
320 aa  149  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.17202e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  33.56 
 
 
309 aa  148  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0996  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.43 
 
 
295 aa  148  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.585262  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2927  riboflavin biosynthesis protein  34.33 
 
 
317 aa  148  1e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0456269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0602  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  38.43 
 
 
316 aa  148  1e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2744  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.86 
 
 
347 aa  147  2e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1058  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.59 
 
 
311 aa  147  2e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2891  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.8 
 
 
311 aa  147  2e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831946  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5826  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  34.33 
 
 
326 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.27 
 
 
312 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2958  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  34.56 
 
 
311 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.29832e-06  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3137  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  34.56 
 
 
311 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00248689  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3040  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  34.56 
 
 
311 aa  146  4e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00882094  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1459  riboflavin kinase / FAD synthetase  33.68 
 
 
320 aa  146  4e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  6.64763e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2724  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.56 
 
 
311 aa  146  4e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.03356e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1809  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.89 
 
 
303 aa  146  4e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.9 
 
 
309 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0967  riboflavin biosynthesis protein RibF (riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase)  33.77 
 
 
328 aa  145  7e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.88 
 
 
321 aa  145  7e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  7.35935e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.49 
 
 
308 aa  145  7e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4052  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.47 
 
 
313 aa  145  7e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1273  riboflavin biosynthesis protein RibF  33.56 
 
 
296 aa  145  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.609723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3785  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  33.67 
 
 
313 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0688887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  33.9 
 
 
320 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.97835e-07  hitchhiker  1.24783e-05 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0180  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.69 
 
 
329 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.01321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0424  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.02 
 
 
330 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0612  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  34.35 
 
 
314 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.115533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3161  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.95 
 
 
327 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3848  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  32.08 
 
 
341 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2222  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.13 
 
 
321 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  0.133789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>