289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0068 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 116 aa  233  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  98.28 
 
 		 116 aa  229  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1906  preprotein translocase, YajC subunit  56.03 
 
 		 116 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1339  preprotein translocase, YajC subunit  65.79 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  39.56 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  40.86 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  38.32 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  42.5 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  36.84 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  37.11 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0391  preprotein translocase, YajC subunit  44.87 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000430502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  39.25 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  35.16 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  43.53 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  31.18 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  37.5 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1117  preprotein translocase, YajC subunit  40.38 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.876099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  30.93 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  38.83 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  31.48 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0145  protein translocase subunit yajC  44.9 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0155516  hitchhiker  0.00195414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  34.52 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  36.89 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1757  preprotein translocase subunit YajC  41.11 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000115206  hitchhiker  0.00353276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  39.6 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  38.89 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  37.78 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  37.18 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  37.18 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  40 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3519  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0958686  normal  0.24263 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  35.63 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  38.67 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  38.82 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  34.94 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  31.3 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  36.05 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.87 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  39.47 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  35 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  32.32 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  34.34 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1448  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000194286  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  38.04 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1436  protein translocase subunit yajC  40 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000109142  hitchhiker  0.000636763 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  39.47 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  32.32 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  36.9 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1427  preprotein translocase YajC subunit  40.54 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000644029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  38.75 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  38 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2336  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000343241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14610  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1291  preprotein translocase subunit YajC  38.16 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  30.93 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  31.18 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  34.29 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>