More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0066 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0066  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
293 aa  582  1e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0066  protein-export membrane protein SecF  96.25 
 
 
293 aa  536  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1904  protein-export membrane protein SecF  57.62 
 
 
302 aa  354  9e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1341  protein-export membrane protein SecF  55.03 
 
 
298 aa  334  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1115  protein-export membrane protein SecF  51.02 
 
 
302 aa  294  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  37.24 
 
 
286 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  37.97 
 
 
759 aa  201  8e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.19 
 
 
762 aa  197  2e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1770  protein-export membrane protein SecF  38.98 
 
 
307 aa  196  5e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  40.14 
 
 
304 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  38.57 
 
 
740 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0012  preprotein translocase subunit SecF  37.05 
 
 
308 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  2.96376e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  39.73 
 
 
307 aa  190  3e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.01903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  37.37 
 
 
280 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  4.49698e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 
304 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  36.93 
 
 
304 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.06623e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  40.21 
 
 
291 aa  184  2e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  34.97 
 
 
311 aa  184  2e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  39.39 
 
 
311 aa  184  2e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  34.78 
 
 
310 aa  183  2e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.49124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.49 
 
 
989 aa  182  4e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  35.59 
 
 
290 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.33 
 
 
761 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  37.17 
 
 
309 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  37.81 
 
 
323 aa  180  3e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1713  SecF protein  34.68 
 
 
327 aa  180  3e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24873  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  37.04 
 
 
301 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  35.05 
 
 
308 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.33 
 
 
996 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2196  preprotein translocase subunit SecF  36.92 
 
 
289 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.26 
 
 
310 aa  176  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  38.05 
 
 
315 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1454  protein-export membrane protein SecF  38.24 
 
 
308 aa  175  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0298464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  37 
 
 
302 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1408  protein translocase subunit secF  36.24 
 
 
317 aa  174  2e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1907  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 
289 aa  174  2e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0418717  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  37.67 
 
 
315 aa  174  2e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.79 
 
 
785 aa  173  3e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.79 
 
 
785 aa  173  3e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  34.85 
 
 
322 aa  173  4e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  37.41 
 
 
310 aa  173  4e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  33.66 
 
 
311 aa  172  4e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  39.93 
 
 
292 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  35.88 
 
 
323 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  36.18 
 
 
900 aa  172  7e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  35.64 
 
 
735 aa  172  7e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  39.13 
 
 
315 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  36.45 
 
 
322 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 
305 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.25 
 
 
977 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1898  protein translocase subunit secF  36.27 
 
 
314 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186497  normal  0.970453 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  34.15 
 
 
305 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.14 
 
 
995 aa  170  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  36.24 
 
 
301 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2072  protein translocase subunit secF  35.79 
 
 
325 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  36.79 
 
 
302 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  34.47 
 
 
303 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.33 
 
 
1055 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  34.47 
 
 
303 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  34.35 
 
 
303 aa  169  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.37336e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  36.39 
 
 
1001 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  36.18 
 
 
315 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.25 
 
 
844 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  36.52 
 
 
307 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.11 
 
 
759 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.66 
 
 
844 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  36.95 
 
 
291 aa  166  3e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
302 aa  167  3e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  35.62 
 
 
296 aa  166  3e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  37.63 
 
 
313 aa  167  3e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  36.39 
 
 
316 aa  166  3e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.17 
 
 
845 aa  167  3e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  40.21 
 
 
315 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  35.43 
 
 
305 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  36.18 
 
 
306 aa  166  5e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.83 
 
 
844 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.59 
 
 
846 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2349  preprotein translocase subunit SecF  38.62 
 
 
312 aa  166  6e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1799  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
324 aa  166  6e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  30.48 
 
 
316 aa  165  7e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  34.56 
 
 
323 aa  165  7e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0445  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
324 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  30.48 
 
 
337 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  36.43 
 
 
302 aa  164  1e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  32.29 
 
 
302 aa  164  1e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0673  preprotein translocase subunit SecF  31.02 
 
 
299 aa  164  1e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.392414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 
322 aa  164  2e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 
322 aa  164  2e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0013  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 
311 aa  163  2e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.158e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0034  preprotein translocase subunit SecF  34.42 
 
 
311 aa  164  2e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  36.67 
 
 
322 aa  164  2e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  32.32 
 
 
302 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  38.38 
 
 
316 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  32.66 
 
 
302 aa  163  4e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  34.88 
 
 
313 aa  162  4e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  33.77 
 
 
323 aa  162  4e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 
323 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 
323 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2856  protein-export membrane protein SecF  35.52 
 
 
318 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.114618 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  34.3 
 
 
323 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>