More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0065 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
355 aa  716    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  97.46 
 
 
355 aa  699    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  61.86 
 
 
376 aa  468  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  62.64 
 
 
359 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.93 
 
 
357 aa  425  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.4 
 
 
357 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.54 
 
 
357 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.26 
 
 
357 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.17 
 
 
364 aa  361  9e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  50.28 
 
 
358 aa  359  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.3 
 
 
355 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.01 
 
 
355 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.01 
 
 
355 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.58 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.01 
 
 
357 aa  349  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.58 
 
 
355 aa  346  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.73 
 
 
357 aa  342  5.999999999999999e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.75 
 
 
354 aa  341  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.02 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.17 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.89 
 
 
355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
356 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
358 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  49.15 
 
 
355 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.6 
 
 
358 aa  332  6e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.74 
 
 
355 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  47.18 
 
 
355 aa  325  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.89 
 
 
356 aa  322  7e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.86 
 
 
357 aa  320  3e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.91 
 
 
355 aa  317  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 
354 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.18 
 
 
357 aa  312  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.1 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.51 
 
 
349 aa  299  4e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.94 
 
 
355 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.64 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.61 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.6 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.24 
 
 
354 aa  265  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.13 
 
 
397 aa  208  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  30.31 
 
 
365 aa  202  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.24 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.79 
 
 
240 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  40 
 
 
257 aa  195  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  37.17 
 
 
400 aa  193  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.96 
 
 
400 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  40 
 
 
243 aa  189  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  35.73 
 
 
325 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 
244 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
325 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43.88 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.64 
 
 
353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  36.75 
 
 
245 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.24 
 
 
396 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  40.69 
 
 
239 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.43 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.24 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  36.32 
 
 
245 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2889  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.43 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.32 
 
 
245 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.32 
 
 
245 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.02 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.9 
 
 
245 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
299 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.9 
 
 
245 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.03 
 
 
298 aa  179  8e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.18 
 
 
320 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  39.75 
 
 
289 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.46 
 
 
293 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1618  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.9 
 
 
293 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952229  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.8 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.32 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.21 
 
 
291 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.32 
 
 
245 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1380  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.02 
 
 
286 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.34 
 
 
296 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0244  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  39.84 
 
 
294 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
300 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  39.84 
 
 
294 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.96 
 
 
325 aa  177  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2328  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.65 
 
 
294 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.09 
 
 
245 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.2 
 
 
325 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  31.39 
 
 
326 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
296 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.62 
 
 
405 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.8 
 
 
288 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.65 
 
 
294 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.76 
 
 
296 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.65 
 
 
292 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
291 aa  176  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.25 
 
 
294 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000187637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
292 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  37.65 
 
 
270 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
292 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2220  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.25 
 
 
294 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.281714  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2330  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.06 
 
 
292 aa  175  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2862  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2557  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.09 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0967265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>