127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0063 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0063  ribonuclease Z  100 
 
 
280 aa  574  1e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0063  ribonuclease Z  98.57 
 
 
280 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.715887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  59.5 
 
 
278 aa  362  4e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  54.64 
 
 
279 aa  338  5e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  44.53 
 
 
275 aa  268  7e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3827  hypothetical protein  32.05 
 
 
292 aa  134  2e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0220  hypothetical protein  31.71 
 
 
292 aa  131  1e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2725  ribonuclease Z family protein  30.29 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  normal  0.100634 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.3 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  28.89 
 
 
305 aa  78.2  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0430  ribonuclease Z  28.73 
 
 
318 aa  77.8  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  29.27 
 
 
305 aa  77  3e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  28.73 
 
 
318 aa  76.3  5e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  26.41 
 
 
307 aa  73.9  3e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  25.08 
 
 
314 aa  72  1e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  26.03 
 
 
308 aa  70.9  2e-11  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.52 
 
 
308 aa  71.2  2e-11  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  27.38 
 
 
307 aa  70.1  4e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  28.09 
 
 
291 aa  69.7  4e-11  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  25.93 
 
 
314 aa  70.1  4e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2995  Nuz  31.16 
 
 
279 aa  70.1  4e-11  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.234829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.59 
 
 
310 aa  69.3  6e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.05 
 
 
309 aa  69.3  7e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  28.57 
 
 
291 aa  67.8  2e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  26.74 
 
 
307 aa  67.4  2e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  26.74 
 
 
306 aa  67.4  2e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  26.74 
 
 
306 aa  67.4  2e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.1 
 
 
308 aa  67.4  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.39422e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  26.86 
 
 
305 aa  66.6  4e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  28.09 
 
 
306 aa  65.5  9e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1554  ribonuclease Z  28.74 
 
 
317 aa  65.1  1e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  28.1 
 
 
305 aa  65.1  1e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2497  ribonuclease Z  24.73 
 
 
341 aa  65.5  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.883053  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2553  ribonuclease Z  24.73 
 
 
305 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2657  ribonuclease Z  24.73 
 
 
305 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2449  ribonuclease Z  24.73 
 
 
305 aa  65.1  1e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4033  ribonuclease Z  25.78 
 
 
319 aa  64.3  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299532  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2542  ribonuclease Z  24.73 
 
 
341 aa  64.7  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.144505  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  25.34 
 
 
310 aa  64.7  2e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  26.07 
 
 
321 aa  64.3  2e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  24.66 
 
 
315 aa  63.9  3e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26345  predicted protein  27.84 
 
 
313 aa  63.5  3e-09  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1805  ribonuclease Z  26.09 
 
 
319 aa  62.8  5e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426345  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  27.27 
 
 
313 aa  62.8  6e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  26.03 
 
 
312 aa  62.4  8e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  7.39768e-06  hitchhiker  3.12864e-08 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1210  ribonuclease Z  24.52 
 
 
309 aa  62  1e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  25.66 
 
 
322 aa  61.2  2e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  26.09 
 
 
309 aa  61.2  2e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  24.49 
 
 
314 aa  60.8  2e-08  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  24.73 
 
 
311 aa  61.2  2e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  24.36 
 
 
305 aa  60.1  4e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  26.47 
 
 
304 aa  60.1  4e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4164  ribonuclease Z  26.01 
 
 
307 aa  60.1  4e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4049  ribonuclease Z  26.01 
 
 
307 aa  60.1  4e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  26.01 
 
 
307 aa  60.1  4e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4364  ribonuclease Z  26.01 
 
 
307 aa  60.1  4e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  24.36 
 
 
305 aa  59.7  5e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  24.36 
 
 
305 aa  59.7  5e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  24.36 
 
 
305 aa  59.7  5e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  24.36 
 
 
305 aa  59.7  5e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  24.36 
 
 
311 aa  59.7  5e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4274  ribonuclease Z  25.64 
 
 
307 aa  59.3  7e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0985  ribonuclease Z  26.01 
 
 
307 aa  59.3  7e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3887  ribonuclease Z  26.01 
 
 
307 aa  59.3  7e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4210  ribonuclease Z  25.64 
 
 
307 aa  59.3  7e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  24.37 
 
 
311 aa  58.9  8e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2169  ribonuclease Z  25.17 
 
 
323 aa  58.9  8e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0974694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0654  ribonuclease Z  24.22 
 
 
307 aa  58.9  9e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.296839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1839  ribonuclease Z  25.79 
 
 
321 aa  58.9  9e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.885199  normal  0.0537997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4250  ribonuclease Z  26.01 
 
 
307 aa  58.5  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  24.63 
 
 
299 aa  58.2  2e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  24.1 
 
 
305 aa  57.4  2e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.82 
 
 
327 aa  57  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  23.18 
 
 
345 aa  57  4e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  2.63844e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  24.91 
 
 
328 aa  56.2  6e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  23.89 
 
 
309 aa  55.5  1e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1475  beta-lactamase superfamily hydrolase  24.61 
 
 
318 aa  54.3  2e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  26.24 
 
 
301 aa  54.3  2e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  25.64 
 
 
307 aa  54.7  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.73 
 
 
304 aa  54.7  2e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0782  ribonuclease Z  32.67 
 
 
319 aa  53.1  4e-06  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.98 
 
 
313 aa  53.1  5e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  26.67 
 
 
303 aa  53.1  5e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3634  ribonuclease Z  25.98 
 
 
319 aa  53.1  5e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  25.89 
 
 
315 aa  52.8  6e-06  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  23.85 
 
 
312 aa  52.8  6e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  26.38 
 
 
309 aa  52.8  7e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  25.62 
 
 
313 aa  52  1e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  26.44 
 
 
393 aa  51.6  1e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  24.32 
 
 
326 aa  51.6  1e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  24.04 
 
 
305 aa  51.6  1e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  27.31 
 
 
318 aa  52  1e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  23.02 
 
 
302 aa  50.8  3e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1808  ribonuclease Z  22.01 
 
 
354 aa  50.1  4e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0346445  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  25 
 
 
308 aa  50.1  5e-05  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  23.38 
 
 
314 aa  49.7  6e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  23.38 
 
 
314 aa  49.7  6e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15501  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.25 
 
 
312 aa  49.3  8e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  27.73 
 
 
318 aa  48.9  9e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  26.3 
 
 
287 aa  48.9  9e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  6.91229e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>