131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0062 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  274  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  99.29 
 
 
140 aa  272  1e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  57.25 
 
 
136 aa  147  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  52.94 
 
 
152 aa  139  2e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  34.97 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  34.97 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  34.27 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  34.27 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  32.87 
 
 
142 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  80.1  1e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  36.17 
 
 
143 aa  74.3  6e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  38.3 
 
 
167 aa  73.6  8e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  32.65 
 
 
144 aa  72.8  1e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  35.42 
 
 
143 aa  71.2  4e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  37.24 
 
 
156 aa  70.1  1e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  31.25 
 
 
141 aa  68.6  3e-11  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  34.03 
 
 
144 aa  67.4  6e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  34.03 
 
 
144 aa  67.4  6e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  34.03 
 
 
144 aa  67.4  6e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0563  hypothetical protein  33.79 
 
 
156 aa  67  8e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.308854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  33.8 
 
 
143 aa  63.5  9e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  62.8  2e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  32.62 
 
 
150 aa  62  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  29.86 
 
 
145 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.66 
 
 
143 aa  62  3e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  35.04 
 
 
148 aa  61.2  5e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 
154 aa  60.5  7e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.98113e-07 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  32.54 
 
 
146 aa  59.7  1e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  27.33 
 
 
147 aa  59.7  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  31.65 
 
 
153 aa  58.9  2e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  36.73 
 
 
141 aa  59.3  2e-08  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  29.37 
 
 
145 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  27.54 
 
 
144 aa  58.5  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  27.59 
 
 
153 aa  58.2  4e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  29.41 
 
 
144 aa  57.8  5e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  31.69 
 
 
147 aa  57.8  5e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.87 
 
 
141 aa  57.4  6e-08  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  28.47 
 
 
143 aa  57.4  7e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  28.68 
 
 
153 aa  57  8e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.78 
 
 
153 aa  57  8e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  31.21 
 
 
146 aa  56.6  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0971  protein of unknown function DUF107  26.03 
 
 
158 aa  56.2  1e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160889  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  28.47 
 
 
145 aa  56.6  1e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  34.51 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  30.77 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.89934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  29.37 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  31.47 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  56.2  2e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  30.99 
 
 
143 aa  55.1  3e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  31.69 
 
 
150 aa  55.1  3e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
147 aa  55.1  3e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  26.21 
 
 
151 aa  55.1  3e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.78 
 
 
151 aa  54.7  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.06 
 
 
154 aa  54.3  6e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  33.09 
 
 
143 aa  54.3  6e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  32.41 
 
 
152 aa  53.5  1e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  27.86 
 
 
133 aa  52.8  1e-06  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  26.97 
 
 
154 aa  53.1  1e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  29.53 
 
 
147 aa  53.1  1e-06  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  25.34 
 
 
150 aa  52.4  2e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  28.67 
 
 
153 aa  52.8  2e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  28.85 
 
 
158 aa  52.4  2e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  29.92 
 
 
144 aa  52.4  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  32.12 
 
 
455 aa  51.6  3e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  31.94 
 
 
154 aa  51.6  3e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  29.5 
 
 
143 aa  52  3e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 
181 aa  51.2  4e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  30.66 
 
 
143 aa  51.2  5e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  30.14 
 
 
157 aa  51.2  5e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  30.43 
 
 
421 aa  50.8  7e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  30.34 
 
 
152 aa  50.4  8e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  27.86 
 
 
149 aa  50.4  8e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  30.22 
 
 
145 aa  49.7  1e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  31.62 
 
 
458 aa  49.7  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  30.46 
 
 
150 aa  50.1  1e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  29.45 
 
 
151 aa  49.7  1e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  27.74 
 
 
143 aa  49.3  2e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  33.08 
 
 
153 aa  48.5  3e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  27.46 
 
 
151 aa  48.1  3e-05  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  34.07 
 
 
146 aa  47  8e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  27.89 
 
 
153 aa  47  9e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  31.82 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  31.06 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54909e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  31.82 
 
 
140 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  29.37 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  28.97 
 
 
473 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  29.37 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  29.37 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.60855e-07  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  29.29 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  31.62 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  31.18 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>