More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0061 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  100 
 
 
305 aa  610  1e-174  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  99.34 
 
 
305 aa  608  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  82.21 
 
 
304 aa  480  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  76.32 
 
 
310 aa  474  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  72.48 
 
 
309 aa  455  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.38 
 
 
318 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  49.49 
 
 
429 aa  294  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  49.84 
 
 
312 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  46.92 
 
 
369 aa  282  5e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  48.45 
 
 
403 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  46.58 
 
 
369 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  50.18 
 
 
360 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  45.96 
 
 
326 aa  278  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.90764e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  48.97 
 
 
327 aa  278  9e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  48.12 
 
 
398 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12020  SPFH domain, Band 7 family protein  48.08 
 
 
396 aa  274  1e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0191878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.16 
 
 
376 aa  273  2e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.1 
 
 
328 aa  273  4e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  45.08 
 
 
327 aa  272  6e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  46.8 
 
 
394 aa  272  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  43.17 
 
 
356 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  48.36 
 
 
406 aa  268  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  48.91 
 
 
315 aa  266  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.38273e-06 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  45.28 
 
 
356 aa  266  3e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.72 
 
 
314 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  45.9 
 
 
326 aa  263  3e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  48.75 
 
 
439 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  45.49 
 
 
381 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  48.84 
 
 
416 aa  261  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  49.26 
 
 
359 aa  259  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  46.69 
 
 
336 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  42.21 
 
 
305 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  42.21 
 
 
305 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.21 
 
 
305 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  42.21 
 
 
305 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  9.85996e-05 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.21 
 
 
305 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  42.21 
 
 
305 aa  258  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  42.21 
 
 
305 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  42.21 
 
 
305 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.25 
 
 
305 aa  257  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.88 
 
 
305 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.55 
 
 
309 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.8 
 
 
359 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  43.41 
 
 
322 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  43.73 
 
 
345 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  43.61 
 
 
406 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  44.6 
 
 
456 aa  255  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  45.39 
 
 
473 aa  253  2e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.27 
 
 
322 aa  253  2e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.26 
 
 
345 aa  253  4e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  43.27 
 
 
322 aa  253  4e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  43.27 
 
 
322 aa  252  5e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  42.95 
 
 
322 aa  252  5e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  44.26 
 
 
311 aa  252  5e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  42.95 
 
 
322 aa  252  5e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  42.95 
 
 
321 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.95 
 
 
321 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  41.18 
 
 
305 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  41.18 
 
 
305 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  41.18 
 
 
305 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.95 
 
 
321 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  41.18 
 
 
305 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  41.18 
 
 
305 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  42.95 
 
 
322 aa  252  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  44.08 
 
 
319 aa  251  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  44.19 
 
 
361 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  46.54 
 
 
402 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  42.62 
 
 
403 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  42.81 
 
 
322 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.48 
 
 
392 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.48 
 
 
392 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.48 
 
 
392 aa  249  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  44.86 
 
 
401 aa  248  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.38 
 
 
314 aa  248  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.2 
 
 
304 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5341  band 7 protein  43.49 
 
 
307 aa  247  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207546  normal  0.117184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  46.69 
 
 
395 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  43.6 
 
 
321 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  48.16 
 
 
361 aa  246  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  43.05 
 
 
356 aa  243  2e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  46.13 
 
 
329 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.58 
 
 
328 aa  241  8e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  43.94 
 
 
293 aa  241  9e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.58 
 
 
328 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  56.34 
 
 
268 aa  239  6e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  39.61 
 
 
304 aa  238  7e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  56.34 
 
 
268 aa  238  7e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.34 
 
 
268 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  45.42 
 
 
346 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  44.44 
 
 
314 aa  238  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  40.98 
 
 
306 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  39.54 
 
 
304 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  45.02 
 
 
312 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  43.48 
 
 
344 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  42.24 
 
 
304 aa  236  5e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.52 
 
 
316 aa  236  5e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.52 
 
 
316 aa  236  5e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  45.3 
 
 
336 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  48.39 
 
 
361 aa  235  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  44.72 
 
 
345 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>