More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0058 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  100 
 
 
317 aa  627  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  97.79 
 
 
317 aa  619  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0855  thioredoxin reductase  65.62 
 
 
316 aa  417  1e-115  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0553  thioredoxin reductase  64.04 
 
 
316 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.860182  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  53.09 
 
 
340 aa  346  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  50.99 
 
 
323 aa  317  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  50.66 
 
 
312 aa  301  7e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  48.33 
 
 
396 aa  296  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  48.17 
 
 
304 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.90803e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  50.17 
 
 
306 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.68 
 
 
306 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  50.32 
 
 
315 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.88903e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  47.32 
 
 
409 aa  286  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  49.68 
 
 
318 aa  286  3e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  44.97 
 
 
309 aa  278  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.36193e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  46.84 
 
 
309 aa  278  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  7.15153e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  46.67 
 
 
310 aa  276  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.65637e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  45.82 
 
 
310 aa  275  8e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  48.17 
 
 
318 aa  275  1e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  47.84 
 
 
321 aa  274  2e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
318 aa  274  2e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  47.84 
 
 
318 aa  274  2e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
321 aa  274  2e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
318 aa  274  2e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  47.84 
 
 
318 aa  274  2e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  47.84 
 
 
321 aa  274  2e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.28 
 
 
305 aa  273  3e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  47.84 
 
 
318 aa  273  4e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  43.96 
 
 
304 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  47.33 
 
 
318 aa  271  8e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  47.84 
 
 
318 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  48.97 
 
 
306 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  45 
 
 
308 aa  270  3e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98339e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  45.82 
 
 
311 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  45.82 
 
 
311 aa  269  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  47.6 
 
 
304 aa  268  8e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  48.33 
 
 
318 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2898  thioredoxin reductase (NADPH)  48.16 
 
 
309 aa  266  3e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611748  hitchhiker  0.00113285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  44.83 
 
 
304 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0743  thioredoxin reductase  46.64 
 
 
317 aa  262  5e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.08634e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  48.12 
 
 
308 aa  261  9e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  43.46 
 
 
320 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  43.81 
 
 
308 aa  259  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  44.84 
 
 
320 aa  259  6e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  45.97 
 
 
306 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  44.15 
 
 
317 aa  256  2e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  45 
 
 
316 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  43.89 
 
 
311 aa  256  3e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  5.061e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  45.31 
 
 
312 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  45.1 
 
 
313 aa  256  4e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0764  thioredoxin reductase  46.38 
 
 
308 aa  255  5e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.080052  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  46.03 
 
 
321 aa  254  1e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0785  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  45.07 
 
 
556 aa  254  2e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  44.3 
 
 
308 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1071  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.11 
 
 
555 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.332e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  45.1 
 
 
312 aa  253  4e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  45.1 
 
 
312 aa  253  4e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  43.91 
 
 
638 aa  252  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.65 
 
 
407 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  42.47 
 
 
547 aa  251  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  6.75051e-05  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  43.51 
 
 
555 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.79 
 
 
427 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.21838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  47.04 
 
 
327 aa  249  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  45.85 
 
 
326 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  44.12 
 
 
311 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  43.05 
 
 
311 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  42.81 
 
 
302 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.32394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  43.61 
 
 
310 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0860  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.86 
 
 
403 aa  244  1e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.28046e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  42 
 
 
311 aa  244  1e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  44.97 
 
 
307 aa  244  2e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  45.64 
 
 
304 aa  244  2e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  41.59 
 
 
340 aa  243  2e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  44.12 
 
 
320 aa  243  4e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
324 aa  242  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  7.24203e-15 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1340  thioredoxin reductase  46.44 
 
 
306 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.125103  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  41.21 
 
 
334 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  40.46 
 
 
332 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  42.67 
 
 
311 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  44.63 
 
 
319 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  42.33 
 
 
353 aa  239  3e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  44.55 
 
 
325 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  40.92 
 
 
333 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  39.87 
 
 
306 aa  238  8e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  39.87 
 
 
306 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  39.46 
 
 
306 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  43.94 
 
 
307 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  41.58 
 
 
332 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  43.37 
 
 
319 aa  236  5e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00682943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  42.24 
 
 
333 aa  236  5e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  40.2 
 
 
310 aa  236  5e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  40.92 
 
 
311 aa  236  5e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  43.43 
 
 
330 aa  235  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  38.69 
 
 
334 aa  235  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  40.46 
 
 
319 aa  235  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  43.39 
 
 
317 aa  234  1e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  42.91 
 
 
309 aa  234  1e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  41.16 
 
 
330 aa  234  2e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
310 aa  234  2e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  41.55 
 
 
310 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>