More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0054 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  52.32 
 
 
825 aa  807  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.58 
 
 
811 aa  767  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  48.24 
 
 
866 aa  744  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  46.72 
 
 
857 aa  744  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68048e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  47.15 
 
 
866 aa  745  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.23416e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  46.14 
 
 
857 aa  739  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  46.14 
 
 
857 aa  739  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.79848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  50.84 
 
 
864 aa  746  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  46.14 
 
 
857 aa  739  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  46.25 
 
 
857 aa  741  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  46.14 
 
 
857 aa  739  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  46.98 
 
 
861 aa  748  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  48.51 
 
 
879 aa  748  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  48.41 
 
 
889 aa  735  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1996  ATP-dependent chaperone ClpB  50.24 
 
 
866 aa  766  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1608  ATPase AAA-2 domain protein  51.66 
 
 
994 aa  752  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000771621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  51.92 
 
 
814 aa  738  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  51.46 
 
 
894 aa  781  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  4.1024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  52.07 
 
 
823 aa  768  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  47.33 
 
 
860 aa  738  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2969  ATP-dependent chaperone ClpB  48.58 
 
 
872 aa  783  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.472161  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2208  ATP-dependent chaperone ClpB  47.29 
 
 
863 aa  743  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.250502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  49.75 
 
 
826 aa  788  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  48.85 
 
 
834 aa  765  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0314  ATP-dependent chaperone ClpB  51.03 
 
 
861 aa  793  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174502  normal  0.43861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  49.47 
 
 
864 aa  773  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.72053e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  50.5 
 
 
826 aa  774  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1250  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  47.31 
 
 
866 aa  735  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.58 
 
 
811 aa  767  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.83 
 
 
811 aa  771  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.55448e-05  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1970  clpB protein  47.15 
 
 
866 aa  745  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  52.65 
 
 
821 aa  796  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  53.29 
 
 
822 aa  808  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  51.71 
 
 
811 aa  768  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  47.01 
 
 
864 aa  746  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3270  ATP-dependent chaperone ClpB  46.57 
 
 
857 aa  738  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.97344e-05  normal  0.063711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  46.19 
 
 
874 aa  734  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  52.13 
 
 
814 aa  798  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  47.25 
 
 
898 aa  739  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  46.51 
 
 
864 aa  741  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  56.44 
 
 
816 aa  812  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1077  ATPase  47.67 
 
 
866 aa  740  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  51.58 
 
 
811 aa  769  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  46.43 
 
 
874 aa  734  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  47.31 
 
 
857 aa  746  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  48.03 
 
 
859 aa  743  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1426  ATP-dependent chaperone ClpB  47.8 
 
 
865 aa  749  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814742  hitchhiker  0.00462707 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  55.87 
 
 
826 aa  828  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  47.65 
 
 
870 aa  738  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  47.66 
 
 
861 aa  749  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  49.81 
 
 
824 aa  748  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1121  ATPase AAA-2 domain protein  46.57 
 
 
857 aa  738  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0611865  normal  0.087173 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  49.82 
 
 
859 aa  791  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  48.76 
 
 
859 aa  764  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  48.96 
 
 
822 aa  780  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  50.38 
 
 
812 aa  779  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  49.88 
 
 
862 aa  749  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  47.31 
 
 
857 aa  746  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.33942e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  48.96 
 
 
862 aa  746  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  47.22 
 
 
865 aa  751  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  46.72 
 
 
857 aa  744  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.39096e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  47.67 
 
 
839 aa  741  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.18976e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  47.33 
 
 
865 aa  752  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  47.1 
 
 
865 aa  751  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  51.92 
 
 
872 aa  758  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  47.55 
 
 
865 aa  740  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  46.23 
 
 
878 aa  739  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  47.33 
 
 
865 aa  744  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  47.02 
 
 
874 aa  741  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  46.72 
 
 
857 aa  744  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1438  ATPase  60.47 
 
 
791 aa  900  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  52.55 
 
 
820 aa  750  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  100 
 
 
792 aa  1574  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  46.72 
 
 
857 aa  744  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.60565e-06  decreased coverage  6.35783e-07 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  49.88 
 
 
844 aa  756  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  52.17 
 
 
824 aa  793  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4026  ATPase AAA-2 domain protein  49.03 
 
 
868 aa  749  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal  0.203961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  50.7 
 
 
812 aa  782  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  49.88 
 
 
852 aa  756  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  50.56 
 
 
815 aa  797  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  51.96 
 
 
820 aa  778  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  49.6 
 
 
867 aa  793  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  52.08 
 
 
819 aa  739  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  49.54 
 
 
871 aa  790  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.52857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  50 
 
 
858 aa  759  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  50.37 
 
 
837 aa  767  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  49.54 
 
 
880 aa  763  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1343  ATPase AAA-2 domain protein  49.7 
 
 
850 aa  735  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4437  ATP-dependent chaperone ClpB  48.33 
 
 
876 aa  741  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  49.88 
 
 
848 aa  749  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  47.26 
 
 
860 aa  742  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1138  protein disaggregation chaperone  47.2 
 
 
858 aa  750  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  49.07 
 
 
835 aa  758  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  47.34 
 
 
862 aa  736  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0645  ATP-dependent chaperone ClpB  47.01 
 
 
892 aa  751  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  49.28 
 
 
872 aa  776  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1201  ATP-dependent chaperone ClpB  45.39 
 
 
894 aa  734  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  49.3 
 
 
815 aa  743  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  56.81 
 
 
855 aa  766  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  48.83 
 
 
836 aa  749  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>