127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0046 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0046  homoserine O-succinyltransferase  100 
 
 
304 aa  630  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0046  homoserine O-succinyltransferase  100 
 
 
304 aa  630  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1845  homoserine O-succinyltransferase  60.86 
 
 
305 aa  404  1e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.02531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4581  homoserine O-succinyltransferase  63.49 
 
 
307 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.27967e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0733  homoserine O-succinyltransferase  60.53 
 
 
309 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0258153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2599  homoserine O-succinyltransferase  62.88 
 
 
302 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3331  homoserine O-succinyltransferase  60.86 
 
 
306 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00132184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1567  homoserine O-succinyltransferase  61.92 
 
 
302 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0294  homoserine O-succinyltransferase  59.54 
 
 
313 aa  381  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1078  Homoserine O-succinyltransferase  58.22 
 
 
314 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.1303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1956  homoserine O-succinyltransferase  60.67 
 
 
311 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5198  homoserine O-succinyltransferase  57.14 
 
 
301 aa  361  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2925  homoserine O-succinyltransferase  56.15 
 
 
301 aa  355  6e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5423  homoserine O-succinyltransferase  56.15 
 
 
301 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.19745e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5584  homoserine O-succinyltransferase  55.81 
 
 
301 aa  351  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.019403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5257  homoserine O-succinyltransferase  56.15 
 
 
301 aa  350  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5528  homoserine O-succinyltransferase  56.48 
 
 
301 aa  350  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5534  homoserine O-succinyltransferase  55.81 
 
 
301 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.57848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5500  homoserine O-succinyltransferase  56.15 
 
 
301 aa  350  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1189  homoserine O-succinyltransferase  54.28 
 
 
314 aa  350  2e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3924  homoserine O-succinyltransferase  55.81 
 
 
301 aa  349  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0654032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1216  homoserine O-succinyltransferase  55.63 
 
 
319 aa  349  3e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.350697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5103  homoserine O-succinyltransferase  55.81 
 
 
301 aa  348  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.205196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2551  homoserine O-succinyltransferase  52.96 
 
 
321 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5086  homoserine O-succinyltransferase  55.48 
 
 
301 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00854912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2598  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
313 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00675576  hitchhiker  1.29585e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2665  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
313 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00279787  normal  0.638831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02861  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
312 aa  345  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1374  homoserine O-succinyltransferase  52.96 
 
 
316 aa  345  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.968831  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1676  homoserine O-succinyltransferase  52.96 
 
 
313 aa  345  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0112  homoserine O-succinyltransferase  53.62 
 
 
305 aa  345  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.9309  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1493  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
313 aa  344  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.112065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2858  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
313 aa  344  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  hitchhiker  5.57635e-10 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1488  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
313 aa  344  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.256727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1524  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
313 aa  344  9e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.153444  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2784  homoserine O-succinyltransferase  52.63 
 
 
314 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0176984  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1395  homoserine O-succinyltransferase  52.96 
 
 
318 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0631633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2772  homoserine O-succinyltransferase  52.63 
 
 
313 aa  343  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3204  homoserine O-succinyltransferase  51.97 
 
 
314 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0264716  unclonable  2.00152e-08 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2499  homoserine O-succinyltransferase  53.64 
 
 
312 aa  342  3e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1472  homoserine O-succinyltransferase  50.99 
 
 
314 aa  339  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1336  homoserine O-succinyltransferase  51.8 
 
 
314 aa  339  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198455  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3805  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
307 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2588  homoserine O-succinyltransferase  51.64 
 
 
314 aa  337  2e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0439713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0449  homoserine O-succinyltransferase  52.46 
 
 
309 aa  336  3e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3162  homoserine O-succinyltransferase  51.64 
 
 
312 aa  336  4e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4134  homoserine O-succinyltransferase  52.96 
 
 
307 aa  335  4e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1100  homoserine O-succinyltransferase  48.34 
 
 
315 aa  332  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15020  homoserine O-succinyltransferase  52.3 
 
 
304 aa  330  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00909944  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02491  homoserine O-succinyltransferase  54.97 
 
 
313 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3030  homoserine O-succinyltransferase  53.85 
 
 
323 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.436733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4253  homoserine O-succinyltransferase  51.97 
 
 
309 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5655  homoserine O-succinyltransferase  55.91 
 
 
279 aa  327  1e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3984  Homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 
309 aa  327  2e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4017  homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 
309 aa  326  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.149933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03885  homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 
309 aa  326  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03845  hypothetical protein  50.82 
 
 
309 aa  326  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.400251  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3021  homoserine O-succinyltransferase  49.01 
 
 
308 aa  326  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4507  homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 
309 aa  325  4e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4555  homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 
309 aa  325  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.628604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4247  homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 
309 aa  325  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003633  homoserine O-succinyltransferase  53.97 
 
 
313 aa  325  7e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4504  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295159  hitchhiker  0.00456401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4467  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.0469066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5483  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0364  homoserine O-succinyltransferase  50.82 
 
 
309 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3959  homoserine O-succinyltransferase  49.84 
 
 
309 aa  322  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3780  homoserine O-succinyltransferase  49.51 
 
 
309 aa  321  1e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4428  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  320  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0363  homoserine O-succinyltransferase  49.84 
 
 
309 aa  320  2e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4518  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  320  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105129  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0292  homoserine O-succinyltransferase  49.84 
 
 
309 aa  320  2e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0637  homoserine O-succinyltransferase  49.84 
 
 
309 aa  320  2e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.35705  normal  0.0503855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4515  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  320  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4393  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  320  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.442234  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4591  homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
309 aa  320  2e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3489  homoserine O-succinyltransferase  50.66 
 
 
306 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0217  homoserine O-succinyltransferase  49.51 
 
 
309 aa  315  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0394319 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0371  homoserine O-succinyltransferase  49.49 
 
 
299 aa  313  2e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0486  homoserine O-succinyltransferase  49.34 
 
 
306 aa  312  4e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0424  homoserine O-succinyltransferase  49.01 
 
 
322 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3083  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
312 aa  308  7e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2166  homoserine O-succinyltransferase  49.34 
 
 
305 aa  307  1e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0075  homoserine O-succinyltransferase  46.38 
 
 
327 aa  303  3e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1640  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
305 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.35195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0010  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
305 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1593  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
305 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695076  normal  0.229155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0586  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
317 aa  295  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.60384  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0019  homoserine O-succinyltransferase  48.99 
 
 
306 aa  292  4e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1379  homoserine O-succinyltransferase  45.72 
 
 
312 aa  291  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0684  homoserine O-succinyltransferase  48.03 
 
 
301 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.965727  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1130  homoserine O-succinyltransferase  44.26 
 
 
344 aa  285  5e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0141  homoserine O-succinyltransferase  45.25 
 
 
343 aa  284  1e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.711356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0280  homoserine O-succinyltransferase  43.42 
 
 
306 aa  280  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4499  homoserine O-succinyltransferase  44.44 
 
 
308 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697474  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2351  homoserine O-succinyltransferase  45.75 
 
 
313 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412479  normal  0.146068 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7783  homoserine O-succinyltransferase  45.52 
 
 
301 aa  272  4e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0022  homoserine O-succinyltransferase  46.2 
 
 
293 aa  258  8e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1894  homoserine O-succinyltransferase  46.2 
 
 
293 aa  258  8e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2171  Homoserine O-succinyltransferase  43.31 
 
 
289 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>