More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0041 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
643 aa  1291  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  99.69 
 
 
643 aa  1289  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  6.12567e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0379  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 
635 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0040  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 
686 aa  494  1e-138  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0806  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
680 aa  364  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  32.82 
 
 
751 aa  277  4e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  31.21 
 
 
646 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.78 
 
 
732 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  30.93 
 
 
720 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  30.76 
 
 
735 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  31.68 
 
 
734 aa  257  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  30.34 
 
 
739 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 
654 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.46 
 
 
727 aa  250  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.25 
 
 
648 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  29.05 
 
 
714 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  30.43 
 
 
734 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  30.82 
 
 
714 aa  247  5e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  31.43 
 
 
658 aa  245  2e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  30.41 
 
 
727 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  30.56 
 
 
679 aa  244  4e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  31.21 
 
 
727 aa  244  4e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  32.42 
 
 
680 aa  244  4e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  32.6 
 
 
680 aa  244  4e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  32.6 
 
 
667 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.44476e-08 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  28.98 
 
 
728 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  32.78 
 
 
680 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  32.6 
 
 
680 aa  243  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  6.91863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  32.41 
 
 
655 aa  242  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  32.6 
 
 
680 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  32.42 
 
 
673 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.33103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  32.42 
 
 
673 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  32.42 
 
 
680 aa  242  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  1.38665e-10 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 
691 aa  241  3e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.55 
 
 
618 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  32.6 
 
 
679 aa  240  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  29.9 
 
 
709 aa  240  7e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  31.21 
 
 
728 aa  239  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.42 
 
 
642 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  31.24 
 
 
718 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  31.24 
 
 
724 aa  239  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  32.23 
 
 
641 aa  239  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  30.43 
 
 
768 aa  239  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  32.1 
 
 
705 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  29.25 
 
 
638 aa  238  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  29.85 
 
 
687 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  30.34 
 
 
770 aa  238  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  30.14 
 
 
759 aa  238  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  28.79 
 
 
720 aa  237  5e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.05 
 
 
676 aa  237  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  29.24 
 
 
775 aa  236  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  29.93 
 
 
833 aa  236  1e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  31.33 
 
 
718 aa  236  1e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.2 
 
 
779 aa  235  2e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  31.7 
 
 
642 aa  235  2e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  30.67 
 
 
724 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  29.96 
 
 
669 aa  234  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  30.35 
 
 
769 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  29.6 
 
 
723 aa  234  4e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  32.18 
 
 
746 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  30.03 
 
 
776 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.86 
 
 
806 aa  233  7e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  29.06 
 
 
750 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  31.99 
 
 
705 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  31.99 
 
 
705 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  29.55 
 
 
741 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  30.31 
 
 
757 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  31.99 
 
 
705 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  31.99 
 
 
705 aa  231  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.73 
 
 
905 aa  230  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  31.99 
 
 
705 aa  230  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.19 
 
 
776 aa  230  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  29.55 
 
 
941 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.08 
 
 
765 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  29.71 
 
 
706 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  31.99 
 
 
705 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.29 
 
 
649 aa  229  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  31.39 
 
 
679 aa  228  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  30.59 
 
 
757 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  30.69 
 
 
626 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  31.8 
 
 
705 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  28.62 
 
 
712 aa  228  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  29.66 
 
 
750 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 
710 aa  227  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  29.84 
 
 
665 aa  228  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.94 
 
 
645 aa  227  5e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 
795 aa  227  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.6818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.94 
 
 
761 aa  227  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.6 
 
 
643 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  31.56 
 
 
712 aa  226  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  30.48 
 
 
683 aa  226  9e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  31.24 
 
 
705 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.86 
 
 
640 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  30.65 
 
 
714 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  29.98 
 
 
742 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 
763 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  28.86 
 
 
651 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  31.1 
 
 
701 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  28.96 
 
 
758 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  30.43 
 
 
714 aa  224  5e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>