74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0039 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  9.9633e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  40.32 
 
 
203 aa  155  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.56762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  42.57 
 
 
203 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  7.94456e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  35.68 
 
 
215 aa  114  1e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  34.42 
 
 
219 aa  112  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  33.98 
 
 
219 aa  110  1e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  34.95 
 
 
218 aa  110  2e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  34.64 
 
 
211 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  30.95 
 
 
216 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  7.71119e-05  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  31.19 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  32.84 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  33.51 
 
 
212 aa  99  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  30.88 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.7039e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  30.28 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  34.07 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  31.07 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.11676e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  30.14 
 
 
212 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  31.31 
 
 
213 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.80795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  31.07 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  30.29 
 
 
205 aa  83.2  2e-15  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  33.18 
 
 
213 aa  82.8  3e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  3.44688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  33.18 
 
 
213 aa  81.6  7e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.7625e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  31.78 
 
 
213 aa  81.3  9e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  32.71 
 
 
213 aa  80.9  1e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.7674e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  31.9 
 
 
213 aa  79.7  3e-14  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.3843e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  31.9 
 
 
213 aa  79.7  3e-14  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  31.9 
 
 
213 aa  79.7  3e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  6.07891e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  31.31 
 
 
219 aa  79  4e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.67984e-07  hitchhiker  6.16024e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  31.9 
 
 
213 aa  79  5e-14  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  29.67 
 
 
213 aa  78.6  7e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.941e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 
224 aa  78.2  7e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  28.95 
 
 
234 aa  76.6  2e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.03792e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  31.35 
 
 
221 aa  76.6  2e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  30.48 
 
 
217 aa  76.6  2e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  30.69 
 
 
216 aa  71.6  7e-12  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  30.05 
 
 
215 aa  70.5  2e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  27.36 
 
 
454 aa  69.3  3e-11  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.34495e-07  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  26.34 
 
 
213 aa  68.6  7e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  28.8 
 
 
226 aa  67.4  1e-10  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  1.41899e-06 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  30.73 
 
 
212 aa  65.9  4e-10  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 
209 aa  63.2  2e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  31.11 
 
 
212 aa  63.5  2e-09  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  28.42 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  29.88 
 
 
216 aa  61.6  8e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.50801e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  30.49 
 
 
231 aa  60.5  1e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  29.78 
 
 
211 aa  60.1  2e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  31.58 
 
 
229 aa  59.7  3e-08  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  28.5 
 
 
210 aa  59.3  3e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  28.96 
 
 
216 aa  58.9  5e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  58.9  5e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  26.67 
 
 
211 aa  54.3  1e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  27.32 
 
 
228 aa  54.3  1e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7051e-07 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  28.42 
 
 
226 aa  53.9  2e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0259  hypothetical protein  24.38 
 
 
208 aa  53.1  3e-06  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0230  thiamine pyrophosphokinase  31.46 
 
 
241 aa  52  6e-06  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  25.27 
 
 
230 aa  51.6  8e-06  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  29.89 
 
 
219 aa  51.2  9e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  1.47965e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0410  thiamine pyrophosphokinase  28 
 
 
204 aa  51.2  1e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  27.07 
 
 
223 aa  50.8  1e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1307  hypothetical protein  24.87 
 
 
213 aa  49.3  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00543871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1282  hypothetical protein  24.87 
 
 
213 aa  49.3  4e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0360519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  27.91 
 
 
220 aa  48.5  6e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  25.7 
 
 
297 aa  48.1  8e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  26.26 
 
 
218 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  24.74 
 
 
211 aa  47  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  27.11 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  26.89 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl224  hypothetical protein  23.49 
 
 
207 aa  44.7  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.80921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3405  thiamine pyrophosphokinase  32.86 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.465121  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01170  thiamine pyrophosphokinase, putative  27.78 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.772914  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  25.64 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>