More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0037 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  100 
 
 
501 aa  996  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00693e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  100 
 
 
501 aa  996  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  43.26 
 
 
495 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.74042e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  41.12 
 
 
496 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  35.69 
 
 
507 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  7.40913e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.43 
 
 
428 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.60258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.2 
 
 
448 aa  143  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  26.53 
 
 
469 aa  142  1e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.15 
 
 
452 aa  141  2e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  27.15 
 
 
452 aa  141  2e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2117  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.59 
 
 
354 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
454 aa  135  1e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.76 
 
 
450 aa  136  1e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
494 aa  135  2e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.02 
 
 
457 aa  132  1e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  25.73 
 
 
457 aa  132  2e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.51 
 
 
451 aa  130  4e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  24.02 
 
 
549 aa  129  1e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1492  membrane-associated zinc metalloprotease  38.02 
 
 
354 aa  129  1e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  25.59 
 
 
454 aa  129  1e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.63 
 
 
479 aa  128  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  26.97 
 
 
452 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2749  membrane-associated zinc metalloprotease  38.34 
 
 
354 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  27.13 
 
 
450 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  24.81 
 
 
453 aa  126  8e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1122  peptidase RseP  35.71 
 
 
360 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3726  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.27 
 
 
355 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.41 
 
 
455 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.79 
 
 
561 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.97 
 
 
449 aa  124  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  25.73 
 
 
452 aa  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  26.02 
 
 
452 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.193e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1257  peptidase RseP  38.54 
 
 
355 aa  123  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.58691e-05  hitchhiker  0.00178972 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  35.26 
 
 
561 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  37.17 
 
 
356 aa  123  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0692  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.39 
 
 
424 aa  123  8e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0120814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  25.93 
 
 
450 aa  122  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.47 
 
 
355 aa  122  1e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  35.26 
 
 
561 aa  122  1e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.77 
 
 
456 aa  122  1e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.25455e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.9 
 
 
450 aa  122  1e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  25.48 
 
 
456 aa  122  1e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  9.71838e-05  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2914  membrane-associated zinc metalloprotease  32.79 
 
 
354 aa  122  2e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.123834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  25.48 
 
 
456 aa  122  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.13842e-05  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  25.48 
 
 
456 aa  122  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  27.41 
 
 
451 aa  122  2e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.29 
 
 
456 aa  122  2e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  25.3 
 
 
451 aa  122  2e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  27.34 
 
 
450 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  26.86 
 
 
451 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  35.15 
 
 
348 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1914  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.7 
 
 
355 aa  121  4e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  37.25 
 
 
337 aa  120  5e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1947  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.33 
 
 
335 aa  120  8e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0515  membrane-associated zinc metalloprotease  38.18 
 
 
396 aa  120  8e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  26.07 
 
 
452 aa  119  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.78 
 
 
335 aa  119  1e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2051  putative membrane-associated zinc metalloprotease  35.27 
 
 
372 aa  119  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.37 
 
 
452 aa  118  2e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  38.42 
 
 
446 aa  118  2e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.76 
 
 
450 aa  118  2e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.76 
 
 
450 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  36.92 
 
 
439 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  24.71 
 
 
461 aa  117  4e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.29 
 
 
454 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.11 
 
 
345 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2383  membrane-associated zinc metalloprotease  31.82 
 
 
355 aa  115  1e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2973  zinc metallopeptidase RseP  25.9 
 
 
451 aa  115  1e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  25.15 
 
 
456 aa  116  1e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3703  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.57 
 
 
558 aa  115  2e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.95 
 
 
458 aa  115  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1785  putative membrane-associated zinc metalloprotease  41.89 
 
 
367 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  25.1 
 
 
459 aa  114  3e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.19 
 
 
456 aa  114  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  25.83 
 
 
452 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25 
 
 
455 aa  112  1e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3701  membrane-associated zinc metalloprotease  37.16 
 
 
354 aa  112  1e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.33266e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  25.78 
 
 
450 aa  112  2e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2715  membrane-associated zinc metalloprotease  34.43 
 
 
376 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  32.16 
 
 
349 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0998  peptidase RseP  26.97 
 
 
424 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000230134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1589  membrane-associated zinc metalloprotease  33.33 
 
 
375 aa  110  7e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0981  peptidase RseP  23.87 
 
 
421 aa  109  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.103609  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1436  membrane-associated zinc metalloprotease  36.14 
 
 
338 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.23212  normal  0.10285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.69 
 
 
462 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1782  membrane-associated zinc metalloprotease  33.82 
 
 
377 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  26.21 
 
 
462 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.67 
 
 
480 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  25.69 
 
 
450 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  24.43 
 
 
453 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  5.12767e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.7 
 
 
456 aa  107  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0637  membrane-associated zinc metalloprotease  31.36 
 
 
386 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  34.54 
 
 
347 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1847  peptidase RseP  32.16 
 
 
369 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  6.83327e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4510  putative Zinc metalloprotease  32.67 
 
 
383 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0862  peptidase RseP  37.66 
 
 
380 aa  107  7e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  37.37 
 
 
372 aa  106  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.147315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1705  membrane-associated zinc metalloprotease  34.36 
 
 
353 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07740  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.84 
 
 
357 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3203  membrane-associated zinc metalloprotease  34.59 
 
 
341 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.32825e-05  hitchhiker  3.45421e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>