157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0033 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  99.52 
 
 
209 aa  417  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0033  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.852974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0078  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 
209 aa  191  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  44.55 
 
 
208 aa  191  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0442  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 
174 aa  62  5e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  1.84233e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0948  beta-lactamase domain-containing protein  28.29 
 
 
248 aa  62  6e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0733  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
235 aa  61.2  1e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1393  beta-lactamase domain-containing protein  25.91 
 
 
233 aa  60.1  2e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  27.18 
 
 
237 aa  59.3  3e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 
319 aa  60.1  3e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0597  putative beta-lactamase-like protein  29.05 
 
 
229 aa  59.7  3e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635497  normal  0.0844301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  26.58 
 
 
310 aa  59.3  4e-08  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.09 
 
 
291 aa  57.8  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3180  beta-lactamase domain protein  30.26 
 
 
248 aa  57.4  1e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2298  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 
248 aa  56.6  2e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  24.14 
 
 
312 aa  56.6  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0579  beta-lactamase domain-containing protein  28.67 
 
 
249 aa  56.6  3e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000409851  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  29.76 
 
 
332 aa  56.2  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1091  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
176 aa  56.2  3e-07  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.801328  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4124  Beta-lactamase-like  28.69 
 
 
299 aa  56.6  3e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  29.35 
 
 
266 aa  56.2  4e-07  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 
308 aa  55.5  5e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1537  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
176 aa  54.7  8e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.299515  hitchhiker  0.00550931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
305 aa  54.3  1e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  26.9 
 
 
309 aa  52.4  5e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1393  beta-lactamase-like  30.6 
 
 
308 aa  52.4  5e-06  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363509  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  27.33 
 
 
209 aa  52  6e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  26.63 
 
 
294 aa  52  6e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  27.41 
 
 
566 aa  51.6  7e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
307 aa  52  7e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  26.97 
 
 
337 aa  51.2  1e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 
306 aa  50.8  1e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
262 aa  50.8  1e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129024  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 
266 aa  50.4  2e-05  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  27.06 
 
 
308 aa  49.7  3e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1237  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
248 aa  49.7  3e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0269361  normal  0.588119 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 
311 aa  49.7  3e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  27.44 
 
 
300 aa  50.1  3e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04445  AttM/AiiB family protein  26.98 
 
 
287 aa  49.3  4e-05  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 
259 aa  49.3  4e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  22.14 
 
 
322 aa  49.3  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 
297 aa  48.9  5e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 
308 aa  48.9  6e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  30.66 
 
 
264 aa  48.9  6e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  25.42 
 
 
250 aa  48.5  7e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1673  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 
174 aa  48.5  8e-05  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.779907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0215  beta-lactamase domain protein  23.17 
 
 
252 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
288 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
209 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1331  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0319201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1858  beta-lactamase domain-containing protein  25.81 
 
 
284 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  26.27 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  24.86 
 
 
280 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  27.81 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3579  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00371126  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1268  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 
288 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  27.81 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  26.19 
 
 
295 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  27.91 
 
 
307 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 
311 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 
312 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0090  beta-lactamase domain-containing protein  28.07 
 
 
198 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 
310 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  27.05 
 
 
250 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
306 aa  45.8  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  22.06 
 
 
250 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  35.59 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 
282 aa  45.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 
291 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  24.44 
 
 
250 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0375  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 
176 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.397371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2682  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
283 aa  45.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  22.16 
 
 
308 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.46 
 
 
266 aa  45.1  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 
250 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 
250 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 
250 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.96102e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
303 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  23.7 
 
 
250 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1560  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 
205 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  26.12 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0627  hypothetical protein  32.35 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2396  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  28.93 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.46092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1803  Beta-lactamase-like  25.78 
 
 
261 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 
269 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 
279 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  26.14 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4133  beta-lactamase domain protein  23.24 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2500  beta-lactamase-like  23.53 
 
 
308 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.763303  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  26.22 
 
 
292 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10411  beta lactamase like protein  24.03 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 
451 aa  43.5  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  25.76 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>