More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0021 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0021  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  4.72925e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0021  cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1436  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.31 
 
 
276 aa  199  4e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.49 
 
 
284 aa  199  4e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0378  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.41 
 
 
276 aa  195  7e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.15 
 
 
288 aa  172  6e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  34.35 
 
 
309 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.21 
 
 
311 aa  158  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.27 
 
 
290 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.58 
 
 
290 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.88 
 
 
283 aa  147  2e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.76 
 
 
519 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.54 
 
 
281 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.7 
 
 
287 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.47298e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  31.62 
 
 
295 aa  142  8e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  30.2 
 
 
271 aa  142  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.44 
 
 
308 aa  141  1e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  29.12 
 
 
300 aa  140  2e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2024  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.63 
 
 
287 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.91 
 
 
302 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  32.38 
 
 
270 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
276 aa  138  8e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.45 
 
 
301 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  29.43 
 
 
304 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.41 
 
 
310 aa  136  3e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  33.2 
 
 
289 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  33.2 
 
 
289 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
289 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
301 aa  135  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 
270 aa  135  7e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.46 
 
 
298 aa  134  1e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.35 
 
 
273 aa  132  4e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  30.5 
 
 
280 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 
270 aa  130  2e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 
309 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.1 
 
 
278 aa  129  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 
271 aa  129  4e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  30.16 
 
 
272 aa  129  4e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.62806e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.7 
 
 
299 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1383  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.1 
 
 
473 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
271 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.35 
 
 
370 aa  128  9e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 
296 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.94 
 
 
296 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1412  hypothetical protein  34.66 
 
 
295 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.57 
 
 
296 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.06 
 
 
268 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.74 
 
 
293 aa  125  8e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.58 
 
 
302 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  28.63 
 
 
272 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
293 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0659  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.01 
 
 
266 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.16 
 
 
297 aa  122  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  29.15 
 
 
280 aa  121  1e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.79 
 
 
343 aa  120  2e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.55 
 
 
293 aa  120  2e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.57 
 
 
277 aa  120  2e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  29.41 
 
 
274 aa  120  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1671  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
284 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 
277 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
293 aa  119  4e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
306 aa  120  4e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
306 aa  119  5e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.69993e-05 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.87 
 
 
291 aa  119  5e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  26.71 
 
 
295 aa  119  5e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
293 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  29.13 
 
 
277 aa  119  8e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.13 
 
 
277 aa  119  8e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  28.22 
 
 
272 aa  117  1e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  27.97 
 
 
283 aa  118  1e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.48 
 
 
293 aa  118  1e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.37 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.7 
 
 
276 aa  117  2e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 
277 aa  117  2e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.86 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.11 
 
 
293 aa  117  2e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.01 
 
 
308 aa  117  2e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
293 aa  116  4e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 
294 aa  116  4e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  29.87 
 
 
280 aa  115  7e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  30.74 
 
 
280 aa  115  7e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  29.87 
 
 
280 aa  115  7e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.48 
 
 
303 aa  115  8e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 
270 aa  114  1e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  30.04 
 
 
296 aa  114  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  30.8 
 
 
295 aa  114  2e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  5.17997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.12 
 
 
290 aa  114  2e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.62 
 
 
303 aa  113  4e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  30.42 
 
 
295 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
275 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  29.76 
 
 
287 aa  112  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.08 
 
 
274 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.03 
 
 
276 aa  112  7e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.44 
 
 
295 aa  110  2e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.44 
 
 
295 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>