More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0020 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 
378 aa  764  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  3.98912e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0020  flagellar biosynthesis regulator FlhF  100 
 
 
378 aa  764  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0377  flagellar biosynthesis regulator FlhF  53.87 
 
 
372 aa  375  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1437  flagellar biosynthesis regulator FlhF  50.66 
 
 
373 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2152  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  36.87 
 
 
372 aa  226  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16670  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.07 
 
 
356 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4133  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  33.58 
 
 
412 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.535146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0791  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.37 
 
 
392 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0874551  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1131  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35.31 
 
 
372 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0486  GTP-binding signal recognition particle  32.51 
 
 
403 aa  201  1e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1747  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.84 
 
 
413 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1672  GTP-binding signal recognition particle  35.57 
 
 
341 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2023  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.59 
 
 
400 aa  191  3e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1314  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  33.59 
 
 
402 aa  189  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1399  GTP-binding signal recognition particle  47.83 
 
 
438 aa  189  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2030  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  31.38 
 
 
389 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2028  flagellar biosynthetic protein FlhF  34.66 
 
 
350 aa  186  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1411  flagellar biosynthetic protein FlhF  33.42 
 
 
381 aa  185  1e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1161  flagellar GTP-binding protein  31.45 
 
 
419 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3285  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  29.91 
 
 
441 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0870  hypothetical protein  31.78 
 
 
395 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1414  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  36.22 
 
 
466 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.37115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3445  GTP-binding signal recognition particle  28.41 
 
 
446 aa  166  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2391  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.68 
 
 
405 aa  163  4e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0589  flagellar biosynthetic protein FlhF  27.31 
 
 
437 aa  162  8e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2694  GTP-binding signal recognition particle  42.41 
 
 
404 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0427  GTP-binding signal recognition particle  38.6 
 
 
452 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0705  flagellar biosynthesis regulator FlhF  35 
 
 
438 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4110  GTP-binding signal recognition particle  39.25 
 
 
447 aa  154  3e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.963643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2500  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  29.56 
 
 
382 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3055  flagellar biosynthetic protein FlhF, putative  38.79 
 
 
441 aa  148  2e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1139  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.55 
 
 
626 aa  148  2e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2596  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  32.67 
 
 
380 aa  145  8e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0276  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.61 
 
 
388 aa  145  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1357  GTP-binding signal recognition particle  31.67 
 
 
378 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0293  flagellar biosynthetic protein FlhF  30.34 
 
 
423 aa  143  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0113568  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0745  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.34 
 
 
388 aa  140  4e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2157  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.29 
 
 
393 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3850  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  33.94 
 
 
481 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.66601e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3766  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  33.03 
 
 
468 aa  134  2e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1485  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  29.21 
 
 
373 aa  132  1e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1508  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.65 
 
 
435 aa  132  1e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1173  flagellar biosynthetic protein FlhF  25.06 
 
 
424 aa  132  1e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141847  normal  0.243928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2282  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.28 
 
 
463 aa  131  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.451131  normal  0.682206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1197  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33 
 
 
461 aa  129  7e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3039  GTP-binding signal recognition particle  36.36 
 
 
452 aa  127  4e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1650  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain  32.46 
 
 
399 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000418792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1341  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.37 
 
 
462 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0061  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.76 
 
 
484 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0102  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.76 
 
 
484 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3053  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.87 
 
 
460 aa  125  8e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.432908  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2292  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.11 
 
 
484 aa  126  8e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1633  flagellar biosynthesis regulator FlhF  33.22 
 
 
467 aa  126  8e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0994643  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1452  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.87 
 
 
460 aa  125  8e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2911  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.87 
 
 
460 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2921  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.87 
 
 
460 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1376  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.4 
 
 
470 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1381  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.67 
 
 
474 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.286129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2561  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.66 
 
 
460 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.287894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1656  flagellar biosynthesis regulator FlhF  39.89 
 
 
495 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  2.27361e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3212  flagellar biosynthesis regulator FlhF  31.08 
 
 
458 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2686  flagellar biosynthetic protein FlhF  35.71 
 
 
446 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06207  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.5 
 
 
551 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00959  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.5 
 
 
551 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.136085  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0074  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.24 
 
 
481 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0983  GTP-binding signal recognition particle  38.3 
 
 
466 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.10552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1357  flagellar biosynthesis regulator FlhF  32.75 
 
 
458 aa  122  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592498  normal  0.109972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1297  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.2 
 
 
458 aa  122  1e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113598  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3051  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.63 
 
 
464 aa  122  1e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.03242 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1364  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.2 
 
 
458 aa  122  1e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.789112  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.19 
 
 
379 aa  121  2e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03146  flagellar biosynthesis regulator FlhF  30.8 
 
 
503 aa  122  2e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1748  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.19 
 
 
379 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0233  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.1 
 
 
461 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002830  flagellar biosynthesis protein FlhF  37.16 
 
 
505 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00231681  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.5 
 
 
458 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00655433  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0367  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.97 
 
 
452 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0407274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0479  GTP-binding signal recognition particle  38.76 
 
 
585 aa  116  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.530078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1977  GTP-binding signal recognition particle  26.51 
 
 
437 aa  115  1e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1864  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.96 
 
 
542 aa  115  1e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625266  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1517  flagellar biosynthesis regulator FlhF  38.62 
 
 
513 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3700  flagellar biosynthesis regulator FlhF  26.28 
 
 
825 aa  112  1e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.528557  normal  0.0206253 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0180  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  30.48 
 
 
657 aa  111  2e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000220728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0703  flagellar biosynthesis regulator FlhF  36.65 
 
 
362 aa  111  2e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1336  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  34.39 
 
 
424 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.550768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  36.89 
 
 
462 aa  109  8e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3429  GTP-binding signal recognition particle  30.1 
 
 
427 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.911214  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2166  flagellar biosynthetic protein FlhF  35.26 
 
 
527 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4180  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.91 
 
 
632 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2728  signal recognition particle protein  33.5 
 
 
484 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4068  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.91 
 
 
632 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2014  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-protein  26.47 
 
 
729 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3878  signal recognition particle protein  32.48 
 
 
498 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515054  normal  0.639996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1977  flagellar biosynthesis protein FlhF  24.15 
 
 
442 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218828  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5617  flagellar biosynthesis regulator FlhF  34.92 
 
 
804 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45660  flagellar biosynthesis regulator FlhF  24.08 
 
 
429 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.311812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0183  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.23 
 
 
588 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3372  flagellar biosynthesis regulator FlhF  28.42 
 
 
587 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303605  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1392  flagellar biosynthesis regulator FlhF  37.91 
 
 
615 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.70556  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  37.95 
 
 
458 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>