254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0017 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
256 aa  491  1e-138  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
256 aa  491  1e-138  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  41.27 
 
 
254 aa  195  5e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0961  type III secretion system inner membrane R protein  35.83 
 
 
255 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  37.23 
 
 
257 aa  145  4e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  32.24 
 
 
265 aa  115  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  33.78 
 
 
258 aa  114  2e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  29.57 
 
 
261 aa  111  1e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  29.83 
 
 
260 aa  111  1e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  31.74 
 
 
253 aa  110  2e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  31.17 
 
 
259 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  30.42 
 
 
255 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  30.47 
 
 
260 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  31.07 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  25.5 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  25.38 
 
 
265 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25.5 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.16 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  28.19 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  28.92 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  27.42 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  30.47 
 
 
255 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  28.95 
 
 
255 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.89137e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  23.46 
 
 
264 aa  89  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  30.41 
 
 
265 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  29.15 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  28.96 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  29.67 
 
 
240 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  28.22 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  23.98 
 
 
262 aa  85.1  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  27.97 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  28.57 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  23.98 
 
 
262 aa  85.1  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  23.98 
 
 
262 aa  85.1  1e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  27.6 
 
 
256 aa  84.7  1e-15  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  29.82 
 
 
261 aa  85.1  1e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  29.2 
 
 
261 aa  84  2e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  28.12 
 
 
262 aa  82  8e-15  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  26.05 
 
 
262 aa  82  9e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  27.76 
 
 
256 aa  82  9e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  29.11 
 
 
247 aa  81.3  2e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  27.57 
 
 
253 aa  80.9  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  24.08 
 
 
258 aa  80.1  3e-14  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  25.21 
 
 
261 aa  79.7  4e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  24.23 
 
 
261 aa  79.7  4e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  27.63 
 
 
263 aa  79  7e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  26.72 
 
 
260 aa  78.2  1e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  25.22 
 
 
255 aa  77.8  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 
261 aa  77  2e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  30.35 
 
 
260 aa  77.4  2e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  25.75 
 
 
267 aa  77  2e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.00642e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  28.22 
 
 
259 aa  76.3  5e-13  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  24.7 
 
 
265 aa  75.9  7e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  26.05 
 
 
267 aa  75.5  7e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  28.11 
 
 
264 aa  75.5  8e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  26.7 
 
 
239 aa  75.1  9e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  29.02 
 
 
264 aa  74.7  1e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  28.23 
 
 
266 aa  75.1  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 
265 aa  74.3  2e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  26.34 
 
 
256 aa  74.3  2e-12  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  26.85 
 
 
260 aa  74.3  2e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  25.12 
 
 
259 aa  74.3  2e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 
265 aa  73.9  2e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  23.98 
 
 
267 aa  73.6  3e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  26.42 
 
 
257 aa  73.6  3e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  27.54 
 
 
260 aa  73.6  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  23.85 
 
 
265 aa  73.6  3e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  27.93 
 
 
264 aa  73.6  3e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  25.85 
 
 
260 aa  73.2  4e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 
264 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 
264 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 
264 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.10874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  24.69 
 
 
264 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  24.49 
 
 
264 aa  73.2  4e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  24.28 
 
 
265 aa  72.4  7e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  27.12 
 
 
260 aa  72.4  7e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  27.12 
 
 
260 aa  72.4  7e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  27.12 
 
 
260 aa  72.4  7e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  26.05 
 
 
261 aa  72.4  7e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  27.12 
 
 
260 aa  72.4  7e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  27.12 
 
 
260 aa  72  9e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  27.12 
 
 
260 aa  72  9e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 
261 aa  71.6  1e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  24.44 
 
 
263 aa  71.2  1e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  24.14 
 
 
253 aa  71.6  1e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  24.58 
 
 
260 aa  71.6  1e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  24.58 
 
 
260 aa  71.6  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  24.58 
 
 
260 aa  71.6  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  23.46 
 
 
265 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  23.46 
 
 
265 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  23.46 
 
 
265 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  23.46 
 
 
265 aa  71.2  2e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  25.86 
 
 
253 aa  70.5  2e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  26.78 
 
 
260 aa  70.9  2e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  25.68 
 
 
261 aa  70.1  4e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  27.08 
 
 
252 aa  69.7  4e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  26.54 
 
 
259 aa  69.7  4e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  25.43 
 
 
257 aa  69.7  5e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>