94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0013 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  49.52 
 
 
212 aa  203  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  51.4 
 
 
217 aa  193  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  50.47 
 
 
217 aa  192  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  45.45 
 
 
215 aa  145  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  29.91 
 
 
225 aa  80.9  1e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0369  hypothetical protein  28.64 
 
 
222 aa  80.9  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  4.96164e-05  unclonable  4.77389e-11 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  29.91 
 
 
225 aa  80.1  2e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3884  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  79.3  3e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  28.5 
 
 
225 aa  76.3  3e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  26.58 
 
 
224 aa  73.6  2e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  26.7 
 
 
223 aa  72  7e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  26.21 
 
 
223 aa  71.2  9e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  27.32 
 
 
228 aa  70.5  2e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.05279e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  30.49 
 
 
226 aa  70.5  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  27.32 
 
 
226 aa  70.1  2e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.24256e-05  hitchhiker  2.83379e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  27.48 
 
 
226 aa  69.7  3e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  26.13 
 
 
226 aa  68.9  6e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  26.48 
 
 
226 aa  67.4  1e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  26.77 
 
 
227 aa  66.6  2e-10  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  25.23 
 
 
226 aa  66.6  3e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.53337e-08  unclonable  1.17044e-08 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  25 
 
 
238 aa  65.1  7e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  26.83 
 
 
226 aa  64.7  1e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.26131e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  26.01 
 
 
226 aa  64.7  1e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  26.09 
 
 
226 aa  63.2  3e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.30211e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  28.83 
 
 
226 aa  62.8  4e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  24.02 
 
 
226 aa  62  6e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  23.47 
 
 
224 aa  62  6e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  30.1 
 
 
218 aa  60.8  1e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  28.82 
 
 
227 aa  59.3  4e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  26.95 
 
 
225 aa  58.9  5e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  27.11 
 
 
226 aa  58.9  6e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  24.27 
 
 
226 aa  56.2  4e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.29781e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  24.27 
 
 
226 aa  56.2  4e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  5.56938e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  24.27 
 
 
226 aa  56.2  4e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  24.27 
 
 
226 aa  56.2  4e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  29.45 
 
 
208 aa  55.8  5e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  27.27 
 
 
228 aa  55.5  6e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  25.29 
 
 
226 aa  54.7  9e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  26.53 
 
 
211 aa  54.7  9e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  23.64 
 
 
224 aa  53.5  2e-06  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  26.53 
 
 
211 aa  53.1  3e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  22.44 
 
 
226 aa  53.5  3e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  23.3 
 
 
226 aa  52.8  4e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.09083e-06  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  27.59 
 
 
195 aa  52.4  4e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  23.3 
 
 
226 aa  52.8  4e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.59273e-07  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  23.3 
 
 
226 aa  52.8  4e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.06475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  23.3 
 
 
226 aa  52.8  4e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.17729e-07  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  25.68 
 
 
215 aa  52.4  5e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  25.68 
 
 
215 aa  52.4  5e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  26.58 
 
 
228 aa  52.4  5e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.82127e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  26.76 
 
 
215 aa  51.2  1e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  26.02 
 
 
211 aa  50.8  2e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  26.64 
 
 
226 aa  49.3  5e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  28.34 
 
 
205 aa  48.9  5e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  23.12 
 
 
226 aa  48.5  7e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  22.53 
 
 
205 aa  48.5  8e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0152  hypothetical protein  25.7 
 
 
207 aa  48.1  8e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  23.98 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  26.42 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  27.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  22.53 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  23.96 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  23.53 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  24.75 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  26.73 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  25.57 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  25.27 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  25.74 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  24 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  21.98 
 
 
205 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  25.47 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  26.85 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  22.79 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.50489e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  21.98 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  25.42 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  23.9 
 
 
222 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  22.65 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  24.31 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.93859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.52491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  24.77 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.02331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.80581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12847e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  21.82 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  25.25 
 
 
208 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0262  Putitive phosphate transport regulator  22.94 
 
 
240 aa  41.2  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>