More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0012 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  100 
 
 
238 aa  480  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  50.73 
 
 
245 aa  206  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  51.47 
 
 
216 aa  200  2e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  51.56 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  51.58 
 
 
257 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  54.55 
 
 
214 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  52.97 
 
 
199 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  52.43 
 
 
208 aa  183  2e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  53.01 
 
 
216 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  53.44 
 
 
218 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  48.17 
 
 
253 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  51.89 
 
 
256 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  49.47 
 
 
255 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.8 
 
 
210 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  48.69 
 
 
277 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  53.59 
 
 
240 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  54.05 
 
 
209 aa  179  3e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  54.05 
 
 
209 aa  179  3e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.21 
 
 
250 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  47.15 
 
 
219 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  52.41 
 
 
204 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  50.8 
 
 
198 aa  176  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  50.25 
 
 
268 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.13775e-09  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  52.15 
 
 
240 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  52.06 
 
 
259 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  6.48841e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  53.33 
 
 
198 aa  176  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  2.94513e-05 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  51.58 
 
 
257 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.96667e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  51.83 
 
 
260 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  46.07 
 
 
253 aa  174  2e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  54.35 
 
 
201 aa  173  2e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.8 
 
 
201 aa  173  2e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  51.05 
 
 
257 aa  173  2e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.11644e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  47.03 
 
 
198 aa  173  2e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  51.05 
 
 
257 aa  172  4e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  52.15 
 
 
235 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  50.8 
 
 
242 aa  171  7e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  51.05 
 
 
257 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.91 
 
 
202 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  51.05 
 
 
257 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  7.80116e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  51.58 
 
 
212 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  51.05 
 
 
257 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.96428e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.91 
 
 
202 aa  170  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  51.58 
 
 
257 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.3795e-07  unclonable  9.76968e-26 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  53.26 
 
 
208 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  52.15 
 
 
203 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  51.05 
 
 
211 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  51.35 
 
 
209 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.33 
 
 
207 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50.53 
 
 
257 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.97601e-62 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  48.45 
 
 
229 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  49.46 
 
 
206 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.38708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  51.81 
 
 
213 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  47.64 
 
 
279 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50 
 
 
260 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.19683e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  45.11 
 
 
256 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  50 
 
 
213 aa  166  3e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  52.17 
 
 
211 aa  166  3e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  51.1 
 
 
206 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  47.98 
 
 
199 aa  165  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.78 
 
 
207 aa  165  6e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  51.61 
 
 
197 aa  164  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  49.46 
 
 
217 aa  164  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  52.22 
 
 
207 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  49.72 
 
 
229 aa  164  1e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  50 
 
 
207 aa  164  1e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  49.46 
 
 
217 aa  164  1e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  52.22 
 
 
207 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  48.09 
 
 
229 aa  164  2e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50.82 
 
 
198 aa  163  2e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1966  ribonuclease HII  54.55 
 
 
217 aa  164  2e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.413568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  52.91 
 
 
207 aa  163  2e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  52.78 
 
 
217 aa  163  2e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  47.62 
 
 
255 aa  163  2e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  47.87 
 
 
269 aa  163  2e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  51.67 
 
 
218 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  47.4 
 
 
338 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  44.22 
 
 
217 aa  162  4e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  48.95 
 
 
207 aa  162  5e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.72 
 
 
308 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  45.65 
 
 
255 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  45.65 
 
 
255 aa  161  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  47.37 
 
 
212 aa  161  9e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  52.46 
 
 
201 aa  161  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  51.04 
 
 
208 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  49.73 
 
 
248 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  50.27 
 
 
248 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  45.26 
 
 
211 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  48.19 
 
 
195 aa  160  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  54.05 
 
 
206 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  45.83 
 
 
216 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  48.95 
 
 
210 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  51.09 
 
 
197 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  50.27 
 
 
230 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  42.31 
 
 
227 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  49.73 
 
 
218 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  48.42 
 
 
214 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  48.42 
 
 
214 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  48.42 
 
 
214 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  45.6 
 
 
256 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>