167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0008 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0008  OsmC family protein  100 
 
 
138 aa  288  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0008  OsmC family protein  97.1 
 
 
138 aa  284  3e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0549  OsmC family protein  65.44 
 
 
147 aa  191  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0851  OsmC family protein  61.94 
 
 
141 aa  186  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.65109e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1272  OsmC family protein  50.39 
 
 
136 aa  133  1e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.923187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  45.38 
 
 
141 aa  126  8e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  44.62 
 
 
142 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  45.59 
 
 
138 aa  123  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1434  OsmC family protein  47.2 
 
 
138 aa  119  1e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  45.07 
 
 
158 aa  117  5e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  42.31 
 
 
136 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  45.93 
 
 
138 aa  115  2e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.1415e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0597  OsmC family protein  50.38 
 
 
129 aa  112  1e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  41.48 
 
 
149 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  39.42 
 
 
141 aa  108  2e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  3.24994e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  39.42 
 
 
141 aa  108  2e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  39.39 
 
 
140 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  2.80458e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  38.52 
 
 
138 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  40 
 
 
154 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  41.84 
 
 
140 aa  106  8e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  41.84 
 
 
140 aa  106  8e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  41.84 
 
 
140 aa  106  8e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  41.84 
 
 
140 aa  106  8e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  43.26 
 
 
140 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  41.54 
 
 
150 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  43.26 
 
 
140 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  39.39 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  5.66205e-08  hitchhiker  5.00952e-06 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  40 
 
 
142 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.86556e-13  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  41.84 
 
 
140 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  42.55 
 
 
140 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.57395e-07 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  42.55 
 
 
140 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  42.75 
 
 
140 aa  103  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  40 
 
 
140 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  40.3 
 
 
138 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3124  hypothetical protein  39.1 
 
 
140 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  2.00026e-06  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  39.68 
 
 
137 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0605  putative OsmC-like protein  40 
 
 
140 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  7.73894e-09  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  37.88 
 
 
139 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  1.6936e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  40.14 
 
 
140 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  40.6 
 
 
148 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  39.85 
 
 
148 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2565  OsmC family protein  39.39 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  9.28304e-10  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  39.39 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  7.50944e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  42.96 
 
 
135 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  40.62 
 
 
140 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0408  OsmC-like protein  40.74 
 
 
140 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.03576e-07  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  40 
 
 
138 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  39.39 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  6.09045e-11  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  39.85 
 
 
148 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  38.52 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1013  OsmC family protein  39.52 
 
 
151 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  38.52 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.6959e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  39.39 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  38.52 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  38.52 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  2.16559e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  40 
 
 
154 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  8.31828e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0659  OsmC family protein  38.19 
 
 
149 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0732219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0680  OsmC family protein  38.19 
 
 
149 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  0.178697 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  39.26 
 
 
140 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  38.64 
 
 
140 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  6.04896e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  39.55 
 
 
140 aa  100  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  39.26 
 
 
154 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  39.26 
 
 
154 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  4.2421e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  39.26 
 
 
154 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  39.26 
 
 
154 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02740  OsmC family protein  42.11 
 
 
130 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  38.52 
 
 
143 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0111  OsmC family protein  43.09 
 
 
128 aa  100  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.174178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  37.96 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3944  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2607  OsmC/Ohr family protein  39.23 
 
 
133 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3380  OsmC/Ohr family protein  39.26 
 
 
154 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.35507e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2244  OsmC-like protein  40.15 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.990359  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3852  hypothetical protein  40.3 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  41.04 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0930  OsmC family protein  36.11 
 
 
149 aa  95.9  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2780  OsmC family protein  38.81 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.71962e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0153  OsmC family protein  35.56 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.818803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3783  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0730495  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4031  hypothetical protein  39.55 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3701  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0294  hypothetical protein  40.3 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.618056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  37.78 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  37.68 
 
 
149 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  38.57 
 
 
139 aa  94  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0356  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03159  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3731  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3638  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41703e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4666  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00819258  normal  0.261614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5684  OsmC family protein  35.56 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  1.58569e-12  normal  0.43813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3826  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.269487  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0356  OsmC family protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3553  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03207  hypothetical protein  40.71 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0645  OsmC family protein  37.21 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0732  OsmC-like protein  36.55 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0520  OsmC family protein  34.97 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2834  OsmC family protein  38.74 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>