More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0005 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
500 aa  1000  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  98.59 
 
 
498 aa  981  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.92 
 
 
504 aa  404  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.98 
 
 
501 aa  405  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.86 
 
 
515 aa  360  3e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  41.52 
 
 
530 aa  350  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  1.97316e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.58 
 
 
525 aa  346  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  39.15 
 
 
517 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.34 
 
 
524 aa  339  5e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.78 
 
 
530 aa  338  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.26 
 
 
519 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.88 
 
 
510 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.99 
 
 
517 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.69 
 
 
524 aa  329  9e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.65 
 
 
520 aa  327  4e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40 
 
 
532 aa  321  2e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.83 
 
 
514 aa  320  4e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  37.23 
 
 
514 aa  315  1e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  2.87535e-07 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.49 
 
 
511 aa  314  2e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.94 
 
 
524 aa  314  2e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.89 
 
 
521 aa  313  6e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.7421e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  35.55 
 
 
524 aa  309  6e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.00236e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.3 
 
 
490 aa  308  1e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 
509 aa  306  8e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.89 
 
 
533 aa  304  2e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.06 
 
 
513 aa  304  3e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.8 
 
 
516 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  35.74 
 
 
499 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.23 
 
 
492 aa  296  6e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.52 
 
 
521 aa  294  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.27 
 
 
521 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.73 
 
 
524 aa  292  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.97 
 
 
533 aa  289  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.77 
 
 
514 aa  286  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  34.5 
 
 
499 aa  285  1e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36.45 
 
 
519 aa  285  1e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.37 
 
 
519 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.59 
 
 
528 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.11 
 
 
506 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  37.33 
 
 
522 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.26 
 
 
516 aa  267  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1519  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.35 
 
 
556 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.025545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3410  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 
556 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.802721  normal  0.621844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0904  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.21 
 
 
515 aa  256  9e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.56 
 
 
518 aa  254  2e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.93 
 
 
498 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.06 
 
 
499 aa  249  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
492 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.4 
 
 
533 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.53 
 
 
479 aa  245  1e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  34.19 
 
 
511 aa  245  1e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.38 
 
 
504 aa  244  2e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  6.09405e-10  decreased coverage  1.91646e-10 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.59 
 
 
514 aa  243  6e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  5.0145e-06 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  33.85 
 
 
512 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  35.67 
 
 
492 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34 
 
 
499 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.33 
 
 
501 aa  241  3e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  2.11008e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.75 
 
 
499 aa  240  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  4.15893e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.85 
 
 
494 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.08 
 
 
512 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.88 
 
 
499 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  4.05423e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.64 
 
 
494 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  34.55 
 
 
499 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  34.42 
 
 
512 aa  238  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.36231e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.65 
 
 
507 aa  237  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  33.72 
 
 
512 aa  236  5e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0802  YjeF-related protein-like protein  35.03 
 
 
507 aa  236  5e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.43 
 
 
494 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.96302e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.64 
 
 
494 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.55 
 
 
508 aa  236  1e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.48 
 
 
499 aa  236  1e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.33 
 
 
490 aa  234  2e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.6 
 
 
567 aa  233  4e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.85 
 
 
487 aa  233  4e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.48 
 
 
504 aa  233  8e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.6757e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  33.26 
 
 
504 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.6197e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.26 
 
 
504 aa  231  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.33957e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0573  sugar kinase  33.59 
 
 
499 aa  231  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.07 
 
 
542 aa  230  6e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  34.74 
 
 
496 aa  230  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3237  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.55 
 
 
546 aa  229  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.271613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  32.36 
 
 
513 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  33.8 
 
 
492 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  33.81 
 
 
486 aa  226  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.85 
 
 
511 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  33.6 
 
 
488 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.85 
 
 
502 aa  223  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  36 
 
 
436 aa  223  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.54 
 
 
501 aa  223  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.67 
 
 
462 aa  223  9e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2384  hypothetical protein  34.69 
 
 
522 aa  222  1e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2672  ribosomal protein S15  33.53 
 
 
500 aa  220  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  33.33 
 
 
502 aa  218  3e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.71 
 
 
511 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0069  hypothetical protein  32.23 
 
 
504 aa  215  2e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  31.88 
 
 
496 aa  214  2e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.24 
 
 
504 aa  215  2e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.64 
 
 
523 aa  214  2e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1309  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.65 
 
 
528 aa  214  3e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.303647  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  31.14 
 
 
501 aa  214  3e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>