142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0003 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  99.65 
 
 
286 aa  583  1e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  54.35 
 
 
301 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  49.28 
 
 
306 aa  271  8e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  47.84 
 
 
298 aa  255  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  45.94 
 
 
313 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  45.32 
 
 
301 aa  243  2e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  44.09 
 
 
305 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  1.22101e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  43.88 
 
 
336 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  43.91 
 
 
283 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  44.09 
 
 
305 aa  233  4e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  44.32 
 
 
312 aa  231  7e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  42.81 
 
 
312 aa  232  7e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  42.7 
 
 
307 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  44.85 
 
 
313 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  41.07 
 
 
303 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  42.64 
 
 
296 aa  221  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  38.41 
 
 
327 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  43.54 
 
 
315 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  7.43683e-13  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  39.44 
 
 
323 aa  214  1e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 
298 aa  213  3e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 
320 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 
320 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 
319 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 
326 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.52404e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  38.32 
 
 
308 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 
303 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 
287 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  42.75 
 
 
296 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 
303 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 
318 aa  201  2e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  44.26 
 
 
321 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
334 aa  199  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
334 aa  198  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  39.05 
 
 
300 aa  198  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 
319 aa  198  1e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  38.19 
 
 
334 aa  198  1e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  3.3704e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 
300 aa  197  2e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  38.77 
 
 
344 aa  194  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  4.00012e-08 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 
302 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  40.31 
 
 
309 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  42.4 
 
 
373 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  36.26 
 
 
293 aa  185  8e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06983e-07 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  37.31 
 
 
320 aa  184  2e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 
331 aa  179  3e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  3.58558e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
295 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  34.71 
 
 
326 aa  167  3e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 
374 aa  147  2e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 
373 aa  142  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 
373 aa  141  1e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
355 aa  140  2e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 
372 aa  140  3e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
371 aa  139  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  33.45 
 
 
345 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1017  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 
335 aa  58.5  1e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.677632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0922  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
333 aa  57.8  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1563  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 
336 aa  55.8  8e-07  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.356418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
333 aa  54.3  2e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1490  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 
377 aa  53.1  5e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.343112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 
333 aa  52.8  6e-06  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2426  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.95 
 
 
255 aa  52.4  8e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0764987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0980  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.95 
 
 
265 aa  52.4  9e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.777271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0463  radical SAM domain-containing protein  21.58 
 
 
332 aa  51.6  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.838883  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1008  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.95 
 
 
246 aa  52  1e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.312248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00906  pyruvate formate lyase activating enzyme 1  26.95 
 
 
246 aa  52  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.84876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2741  pyruvate formate-lyase activating enzyme  26.95 
 
 
246 aa  52  1e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1063  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.95 
 
 
246 aa  52  1e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2219  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.95 
 
 
246 aa  52  1e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.542279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2694  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.95 
 
 
246 aa  52  1e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00913  hypothetical protein  26.95 
 
 
246 aa  52  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0904  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 
395 aa  52  1e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0776722 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0510  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.65 
 
 
243 aa  50.8  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1003  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.35 
 
 
265 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1068  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.35 
 
 
265 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.763935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 
337 aa  51.2  2e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1083  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.35 
 
 
265 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.704189  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1063  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 
336 aa  51.2  2e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.665632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0491  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.65 
 
 
243 aa  50.8  2e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1034  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.35 
 
 
265 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.712061 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0348  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 
336 aa  51.2  2e-05  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.224287  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0975  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  26.35 
 
 
265 aa  51.2  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0482  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.65 
 
 
243 aa  50.8  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0432  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.28 
 
 
243 aa  50.8  3e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.77 
 
 
353 aa  50.1  5e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0425  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  25.13 
 
 
243 aa  49.7  5e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0566  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.13 
 
 
243 aa  49.7  6e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0564  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  25.13 
 
 
243 aa  49.7  6e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2591  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.75 
 
 
244 aa  49.3  7e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1618  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.75 
 
 
244 aa  49.3  7e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344326  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0421  formate acetyltransferase activating enzyme (pyruvate formate-lyase activating enzyme)  25.13 
 
 
243 aa  49.3  7e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 
362 aa  49.3  8e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0189  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 
344 aa  49.3  8e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1999  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.156539  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0654  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.56 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00347583  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2679  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  25.75 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1422  pyruvate formate lyase-activating enzyme 1  27.22 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0513  pyruvate formate-lyase-activating enzyme  23.68 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 
337 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0427  pyruvate formate-lyase activating enzyme  25.42 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0506  pyruvate formate-lyase activating enzyme  22.16 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0339577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>