More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0001 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  97.05 
 
 
440 aa  871  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
440 aa  892  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.65 
 
 
437 aa  409  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  9.28481e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.34 
 
 
444 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000143167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.16 
 
 
454 aa  375  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  2.97027e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  41.73 
 
 
442 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  37.44 
 
 
450 aa  313  4e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  37.53 
 
 
450 aa  313  5e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  37.93 
 
 
446 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.93 
 
 
446 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  38.8 
 
 
446 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.99 
 
 
446 aa  310  3e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.99 
 
 
446 aa  310  3e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 
446 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 
446 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 
446 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 
446 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 
446 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.88 
 
 
446 aa  308  1e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.95 
 
 
444 aa  305  8e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.39 
 
 
463 aa  303  5e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  37.47 
 
 
436 aa  303  5e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 
457 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.96 
 
 
453 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 
457 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.33 
 
 
449 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  36.43 
 
 
453 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  36.43 
 
 
453 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.18 
 
 
447 aa  293  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  37.17 
 
 
453 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  35.1 
 
 
482 aa  291  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  34.43 
 
 
460 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  35.6 
 
 
441 aa  290  5e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.96 
 
 
443 aa  289  6e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.67 
 
 
458 aa  289  8e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  37.35 
 
 
443 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.33 
 
 
461 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  35.2 
 
 
451 aa  287  3e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.91 
 
 
454 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.36 
 
 
446 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  36.24 
 
 
460 aa  285  1e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  35.1 
 
 
440 aa  285  1e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  36.57 
 
 
490 aa  284  3e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.34 
 
 
476 aa  283  4e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.81 
 
 
453 aa  283  5e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 
458 aa  282  8e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
460 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.74 
 
 
503 aa  279  7e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.05 
 
 
456 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.21 
 
 
450 aa  277  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  36.22 
 
 
445 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  36.78 
 
 
443 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  37.12 
 
 
449 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2357  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.58 
 
 
476 aa  274  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.048166  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 
453 aa  273  4e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  36.38 
 
 
487 aa  273  4e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  35.28 
 
 
453 aa  273  4e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  34.69 
 
 
472 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  33.92 
 
 
481 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  35.2 
 
 
492 aa  270  3e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 
456 aa  270  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.9 
 
 
439 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
480 aa  269  9e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.29 
 
 
480 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
450 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  36.76 
 
 
436 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  34.8 
 
 
489 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  8.45727e-09  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.21 
 
 
477 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.25 
 
 
439 aa  267  3e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.01 
 
 
491 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  35.54 
 
 
491 aa  266  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 
459 aa  266  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  35.98 
 
 
445 aa  265  8e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 
454 aa  265  9e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.81 
 
 
467 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  36.41 
 
 
464 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  33.56 
 
 
478 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  36.62 
 
 
450 aa  263  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.53 
 
 
454 aa  262  9e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0005  chromosomal replication initiation protein  34.48 
 
 
475 aa  262  9e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3008  chromosomal replication initiation protein  33.92 
 
 
471 aa  262  9e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 
464 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.97 
 
 
509 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  34.51 
 
 
477 aa  260  3e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.15 
 
 
441 aa  259  5e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 
492 aa  259  8e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.41 
 
 
498 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.85 
 
 
469 aa  257  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  35.48 
 
 
464 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  34.87 
 
 
463 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.73 
 
 
480 aa  255  1e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  34.82 
 
 
452 aa  255  1e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.26 
 
 
459 aa  254  2e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  33.18 
 
 
436 aa  254  2e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  34.7 
 
 
440 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  40.76 
 
 
615 aa  253  5e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  33.48 
 
 
466 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  42.64 
 
 
440 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  38.61 
 
 
492 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  33.78 
 
 
464 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>