55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TNEU_0 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  TNEU_0  tRNA-OTHER  100 
 
 
117 bp  232  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  92.24 
 
 
116 bp  151  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  54  8e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_9  tRNA-Cys  100 
 
 
111 bp  54  8e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 
112 bp  54  8e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 
106 bp  54  8e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  52  3e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0013  tRNA-His  100 
 
 
74 bp  52  3e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0016  tRNA-His  100 
 
 
75 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.036112 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  96.55 
 
 
99 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0043  tRNA-Met  100 
 
 
94 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.571582  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0042  tRNA-OTHER  100 
 
 
95 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0002  tRNA-His  100 
 
 
72 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.162169  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0014  tRNA-His  100 
 
 
75 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 
100 bp  48.1  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  100 
 
 
75 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  100 
 
 
89 bp  48.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 
112 bp  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 
97 bp  48.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 
100 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  4.4076e-07  normal  0.0293745 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 
93 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 
126 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  100 
 
 
79 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 
118 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 
101 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 
91 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  100 
 
 
72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 
115 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122607  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 
130 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  100 
 
 
117 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  100 
 
 
90 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 
76 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 
78 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  8.79928e-05 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 
101 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.32778 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
90 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  100 
 
 
95 bp  44.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 
97 bp  44.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  100 
 
 
97 bp  44.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 
93 bp  44.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 
92 bp  44.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 
76 bp  44.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 
78 bp  44.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  4.9005e-06  hitchhiker  0.000183919 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 
75 bp  44.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0562636  normal  0.0295646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 
91 bp  44.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 
92 bp  44.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  100 
 
 
93 bp  44.1  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.738588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>