More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3781 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008042  TM1040_3781  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 
151 aa  316  7.999999999999999e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.219086  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0379  methionine-R-sulfoxide reductase  64.81 
 
 
169 aa  216  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2709  peptide methionine sulfoxide reductase  62.82 
 
 
158 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755887  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  54.66 
 
 
167 aa  187  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  59.03 
 
 
167 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  63.64 
 
 
165 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  62.88 
 
 
165 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  53.15 
 
 
166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  56.41 
 
 
198 aa  180  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  56.05 
 
 
167 aa  180  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  63.36 
 
 
165 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  58.46 
 
 
152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  55.35 
 
 
167 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  56.25 
 
 
166 aa  177  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  60.8 
 
 
171 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2864  protein-methionine-S-oxide reductase  66.12 
 
 
161 aa  176  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.578028 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  57.82 
 
 
176 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  57.82 
 
 
176 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  57.82 
 
 
176 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2900  methionine-R-sulfoxide reductase  53.55 
 
 
161 aa  173  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.398126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1480  methionine sulfoxide reductase B  52.53 
 
 
166 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538813  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  58.46 
 
 
174 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  58.4 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  55.33 
 
 
176 aa  170  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00151  methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  58.33 
 
 
168 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0152291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 
174 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5959  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 
171 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109162  normal  0.856375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5715  methionine-R-sulfoxide reductase  62.1 
 
 
171 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.967491  normal  0.285245 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 
171 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  48.45 
 
 
164 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  52.41 
 
 
167 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00141  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  59.68 
 
 
164 aa  163  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 
138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  56.8 
 
 
138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00151  hypothetical protein  59.5 
 
 
168 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0015  methionine sulfoxide reductase B  50.32 
 
 
164 aa  160  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00141  hypothetical protein  59.17 
 
 
164 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0719604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  50.32 
 
 
163 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  48.43 
 
 
164 aa  157  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0016  methionine sulfoxide reductase B  59.83 
 
 
168 aa  157  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.226802  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0016  methionine sulfoxide reductase B  59.32 
 
 
167 aa  157  6e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3504  methionine-R-sulfoxide reductase  48.7 
 
 
160 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  49.04 
 
 
161 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
153 aa  154  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2631  methionine sulfoxide reductase B  51.3 
 
 
157 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.284306  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  48.37 
 
 
161 aa  153  7e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1342  methionine sulfoxide reductase B  56.56 
 
 
155 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  57.26 
 
 
137 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00141  hypothetical protein  56.56 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.540308  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  56.45 
 
 
137 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 
138 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  58.68 
 
 
138 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
135 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1907  methionine-R-sulfoxide reductase  55.04 
 
 
134 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.954215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0352  methionine sulfoxide reductase B  51.13 
 
 
202 aa  148  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2749  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 
154 aa  147  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0381303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  57.38 
 
 
138 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1907  protein-methionine-S-oxide reductase  55.28 
 
 
157 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2656  twin-arginine translocation pathway signal  56.1 
 
 
168 aa  147  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00182298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  52.76 
 
 
155 aa  147  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
185 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1172  twin-arginine translocation pathway signal  59.09 
 
 
156 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  54.92 
 
 
136 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
180 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00141  hypothetical protein  53.33 
 
 
164 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0879  methionine-R-sulfoxide reductase  56.41 
 
 
135 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.950161  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  52.59 
 
 
149 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 
145 aa  140  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4367  methionine-R-sulfoxide reductase  51.67 
 
 
164 aa  140  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
180 aa  140  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  52 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17826  predicted protein  54.24 
 
 
130 aa  138  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000128698  normal  0.029614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  44.9 
 
 
167 aa  137  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  52 
 
 
136 aa  137  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
142 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12448  putative methionine sulfoxide reductase, SelR  45.45 
 
 
148 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.626775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  47.2 
 
 
142 aa  135  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
146 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  44.62 
 
 
134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  49.59 
 
 
142 aa  133  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  50.79 
 
 
131 aa  133  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  49.21 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  49.21 
 
 
136 aa  131  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2940  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.51791  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1780  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
229 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  45.8 
 
 
147 aa  130  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  44.44 
 
 
177 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  47.97 
 
 
135 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  46.83 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  46.15 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  48.82 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  48.36 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  46.1 
 
 
151 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  50.88 
 
 
127 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  49.6 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0857  PilB-related protein  48.78 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>