16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3771 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3771  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  687    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0472674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3993  hypothetical protein  91.79 
 
 		 341 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4762  hypothetical protein  59.1 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3991  hypothetical protein  57.31 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0739  hypothetical protein  41.14 
 
 		 406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5148  hypothetical protein  38.78 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.978654  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4108  hypothetical protein  33.43 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1586  hypothetical protein  37.58 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1594  hypothetical protein  34.86 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3563  hypothetical protein  32.61 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2429  hypothetical protein  27.74 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0288  hypothetical protein  26.9 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2573  hypothetical protein  28.7 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1886  hypothetical protein  27.34 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0649803  hitchhiker  0.00264539 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0100  hypothetical protein  33.71 
 
 		 235 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0601  hypothetical protein  27.93 
 
 		 342 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.755176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>