More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3766 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3766  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2739  ABC transporter related  49.16 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  46.38 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0627  basic organic compound ABC-transporter  50.43 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2436  ABC transporter related  49.58 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2969  ABC transporter related  48.4 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  46.05 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2851  ABC transporter related  44.74 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.924678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5504  ABC transporter related  47.86 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3943  ABC transporter related  44.02 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3624  ABC transporter related  47.86 
 
 		 244 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  43.97 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6166  ABC transporter related  41.74 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.924345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  37.7 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1589  ABC transporter related  43.36 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2475  ABC transporter related  40.98 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1510  ABC transporter related  42.27 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3128  ABC transporter related  40.57 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  40.83 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  37.12 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2298  ABC transporter related  36.18 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2222  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.86 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.746837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  35.6 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0494  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 245 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000537818  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0519  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.18 
 
 		 507 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1759  ABC transporter related  43.78 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  40.17 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  39.06 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1470  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 245 aa  145  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5881  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 		 502 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2484  ABC transporter related  37.66 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000266476 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.2 
 
 		 516 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.2 
 
 		 510 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  39.74 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1393  ABC transporter related  34.06 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.6 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  35.97 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1981  ABC transporter related  37.61 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.308178  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0692  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (ATP-binding protein)  33.9 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.611773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  33.47 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  36.55 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0567  ABC transporter related  37.5 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  36 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1814  ABC transporter-related protein  39.19 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000435855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4583  ABC transporter related  34.36 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000093937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3633  ABC transporter related  38.1 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0354242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2942  ABC transporter  35.74 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.769587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  33.86 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.89 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0190  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.95 
 
 		 329 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  34.31 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.09 
 
 		 240 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  34.31 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  34.73 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  37.02 
 
 		 352 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  35.17 
 
 		 240 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1540  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  33.9 
 
 		 252 aa  135  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00340374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 240 aa  134  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 240 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1468  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  34.44 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1722  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.37 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606951  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3865  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5760  ABC transporter related  38.39 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2151  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.37 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00643103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5384  ABC transporter related  38.39 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.773344  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5473  ABC transporter related  38.39 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2016  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.37 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00167792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  35 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  34.33 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2113  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.48 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000755895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2107  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.48 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2166  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.48 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0966455  hitchhiker  0.00000375322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1045  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  35.37 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00188517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0227  ABC transporter-like  34.07 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1265  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.96 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0153826  normal  0.0123229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1729  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000704293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  34.31 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2691  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  34.96 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0086331  normal  0.026152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>