More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3735 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  88.24 
 
 		 391 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  86.6 
 
 		 388 aa  701    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  86.96 
 
 		 391 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  88.72 
 
 		 391 aa  714    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  796    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  86.7 
 
 		 391 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  78.01 
 
 		 391 aa  634    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  76.49 
 
 		 393 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  76.52 
 
 		 393 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  75.45 
 
 		 408 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  74.48 
 
 		 393 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  75.06 
 
 		 393 aa  597  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  71.65 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  71.91 
 
 		 392 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  71.65 
 
 		 392 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  71.65 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  71.39 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  71.98 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  71.13 
 
 		 394 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  71.39 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  70.88 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  71.06 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  71.39 
 
 		 392 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  71.39 
 
 		 392 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  70.88 
 
 		 392 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  70.62 
 
 		 392 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  70.18 
 
 		 391 aa  567  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  68.3 
 
 		 398 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  68.72 
 
 		 390 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  67.69 
 
 		 390 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  70.28 
 
 		 392 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  68.21 
 
 		 396 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  68.21 
 
 		 390 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0632  acetyl-CoA acetyltransferase  70.26 
 
 		 390 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 		 390 aa  544  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  68.81 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  68.81 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  67.44 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  68.21 
 
 		 390 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  68.21 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  64.12 
 
 		 393 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  63.87 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  63.87 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  63.87 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  64.38 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  64.38 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  64.38 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  63.87 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  63.61 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  63.61 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  63.61 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  63.61 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  64.12 
 
 		 393 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  63.61 
 
 		 393 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  63.36 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  64.03 
 
 		 393 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1469  acetyl-CoA acetyltransferase  65.73 
 
 		 391 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  64.71 
 
 		 393 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  63.61 
 
 		 393 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  63.78 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  64.12 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  64.12 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  63.27 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 		 393 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 		 393 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.79 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 		 393 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  63.1 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 		 392 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 392 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  62.15 
 
 		 393 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  58.97 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 		 395 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  60.81 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 		 394 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>