More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3713 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  71.14 
 
 		 492 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3507  aldehyde dehydrogenase  71.52 
 
 		 494 aa  639    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  decreased coverage  0.0000753817 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3713  betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 447 aa  899    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0945015 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1074  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.13 
 
 		 492 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.178667  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1171  aldehyde dehydrogenase family protein  68.9 
 
 		 492 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304276  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  50.78 
 
 		 495 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  51.23 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  51.23 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  51.9 
 
 		 495 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  51.23 
 
 		 526 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  50.56 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000810218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.89 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 497 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  51.82 
 
 		 496 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 497 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.78 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  49.44 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  48.32 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.66 
 
 		 497 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.03 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 498 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0305  putative aldehyde dehydrogenase  51.64 
 
 		 496 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  48.18 
 
 		 498 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  46.09 
 
 		 503 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  49.44 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  51.01 
 
 		 493 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.77 
 
 		 496 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.34 
 
 		 495 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02680  putative aldehyde dehydrogenase  51.98 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.24739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  50.45 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000892172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.34 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48030  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  51.74 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  49.89 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  46.76 
 
 		 502 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 497 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  49.89 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 		 497 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 495 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  49.77 
 
 		 497 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  46.31 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  45.64 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  49.55 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1909  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.11 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.295691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.3 
 
 		 499 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  46.38 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  45.86 
 
 		 498 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  51.24 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  45.64 
 
 		 498 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.86 
 
 		 498 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  44.97 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.19 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  45.64 
 
 		 498 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  45.41 
 
 		 498 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  45.19 
 
 		 498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  45.41 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.77 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.22 
 
 		 501 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0298  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  50.12 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1330  Aldehyde Dehydrogenase  53.24 
 
 		 498 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174379  normal  0.217301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  45.41 
 
 		 490 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  44.07 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0356  aldehyde dehydrogenase  48.13 
 
 		 489 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  48.09 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.45 
 
 		 497 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  48.09 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0566  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.29 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.61 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  46.77 
 
 		 488 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.67 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  46.85 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  47.87 
 
 		 508 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  46.09 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  45.54 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.55 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  43.85 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  46.15 
 
 		 488 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0386  Aldehyde Dehydrogenase  50.91 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  45.09 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  46.38 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  46.39 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  45.19 
 
 		 492 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.7 
 
 		 528 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 		 490 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.3 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 		 488 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  46.62 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  45.26 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  44.3 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>