More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3649 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  100 
 
 		 267 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  63.74 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  63.36 
 
 		 291 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  62.36 
 
 		 295 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  59.7 
 
 		 270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  56.55 
 
 		 268 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  56.55 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  62.78 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  56.18 
 
 		 268 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  60.69 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  59.16 
 
 		 269 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  55.13 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  56.49 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  54.75 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  56.11 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  58.46 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  54.37 
 
 		 266 aa  265  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  53.99 
 
 		 266 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  53.99 
 
 		 266 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  54.2 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 		 266 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  50.75 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  53.61 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  53.05 
 
 		 266 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0915  phosphomethylpyrimidine kinase  61.69 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.257449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  58.05 
 
 		 267 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 		 266 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  53.82 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 		 266 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  51.15 
 
 		 267 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  57.79 
 
 		 269 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  57.79 
 
 		 269 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  58.43 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  57.79 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  58.17 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 		 264 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  54.91 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  50.76 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  54.96 
 
 		 272 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  57.03 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4939  phosphomethylpyrimidine kinase  61.05 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  55.73 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 		 262 aa  236  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  52.29 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  56.65 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  48.09 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 		 295 aa  228  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  54.34 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  53.26 
 
 		 282 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  56.44 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  51.71 
 
 		 284 aa  224  8e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  46.86 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  56.82 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  48.66 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  58.33 
 
 		 778 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  57.95 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 274 aa  222  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1577  phosphomethylpyrimidine kinase  57.95 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299671  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3232  phosphomethylpyrimidine kinase  57.95 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1352  phosphomethylpyrimidine kinase  57.95 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00443333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2080  phosphomethylpyrimidine kinase  57.95 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  50.19 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2460  phosphomethylpyrimidine kinase  57.58 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  50.77 
 
 		 288 aa  218  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  45.08 
 
 		 269 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  52.49 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 		 335 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>