More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3648 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  83.57 
 
 
578 aa  956  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  55.24 
 
 
571 aa  636  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  100 
 
 
588 aa  1172  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  60.21 
 
 
574 aa  671  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  61.21 
 
 
592 aa  629  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  56.74 
 
 
583 aa  611  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  54.8 
 
 
605 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  48.06 
 
 
574 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  49.82 
 
 
586 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  52.64 
 
 
582 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  46.89 
 
 
585 aa  480  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  47.07 
 
 
585 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  44.06 
 
 
573 aa  463  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  45 
 
 
588 aa  465  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  38.04 
 
 
597 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  38.99 
 
 
590 aa  350  5e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1792  SulP family sulfate permease  38.3 
 
 
570 aa  336  6e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2069  sulphate transporter  37.85 
 
 
570 aa  334  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.130212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  36.77 
 
 
572 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  37.15 
 
 
591 aa  317  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  38.23 
 
 
558 aa  305  1e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  37.01 
 
 
588 aa  287  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  33.52 
 
 
577 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  31.49 
 
 
608 aa  273  5e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  30.72 
 
 
584 aa  271  3e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  30.62 
 
 
626 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  31.13 
 
 
569 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  31.13 
 
 
569 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  32.92 
 
 
711 aa  266  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  1.3918e-05 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  31.84 
 
 
586 aa  263  5e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  31.49 
 
 
560 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  31.21 
 
 
580 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  34.18 
 
 
584 aa  260  5e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  30.71 
 
 
579 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  29.74 
 
 
583 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  30.27 
 
 
573 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.31 
 
 
588 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  31.4 
 
 
603 aa  256  1e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.93 
 
 
581 aa  255  2e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  31.36 
 
 
703 aa  254  4e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  33.57 
 
 
571 aa  253  7e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  31.16 
 
 
703 aa  253  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  30.57 
 
 
620 aa  249  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  35.26 
 
 
571 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.48 
 
 
711 aa  246  1e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  30.19 
 
 
595 aa  241  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.5 
 
 
584 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  28.88 
 
 
596 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  28.44 
 
 
573 aa  233  7e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  32.17 
 
 
521 aa  233  8e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  1.10429e-09 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  30.94 
 
 
586 aa  233  8e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.25 
 
 
576 aa  233  8e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  31.2 
 
 
522 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  28.44 
 
 
570 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  29.84 
 
 
575 aa  230  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  32.32 
 
 
730 aa  230  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  30 
 
 
580 aa  230  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.9535e-08  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  30.19 
 
 
574 aa  229  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  30.55 
 
 
574 aa  229  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  30.65 
 
 
521 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  9.1476e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  28.44 
 
 
570 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  29.47 
 
 
603 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  28.9 
 
 
568 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  28.9 
 
 
568 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  30.37 
 
 
522 aa  221  4e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  28.72 
 
 
568 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  28.57 
 
 
578 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  30.13 
 
 
522 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  30 
 
 
599 aa  217  6e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  27.19 
 
 
570 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  29.74 
 
 
557 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  31.96 
 
 
563 aa  215  2e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  33.4 
 
 
569 aa  214  3e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  28.68 
 
 
575 aa  214  4e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  32.09 
 
 
559 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  29.85 
 
 
576 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  29.17 
 
 
546 aa  210  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  28.45 
 
 
573 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2275  sulphate transporter  29.95 
 
 
580 aa  210  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.571929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  30.26 
 
 
517 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1599  sulphate transporter  29.2 
 
 
580 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  29.98 
 
 
590 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  28.04 
 
 
582 aa  207  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  32.35 
 
 
573 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  28.21 
 
 
590 aa  207  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  30.41 
 
 
591 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  30.07 
 
 
556 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  29.69 
 
 
565 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  27.87 
 
 
567 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  30.33 
 
 
517 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0897  sulfate transporter  36.98 
 
 
690 aa  203  9e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.675666  normal  0.770489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  29.04 
 
 
574 aa  202  1e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  31.68 
 
 
599 aa  202  2e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  27.62 
 
 
585 aa  202  2e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  27.62 
 
 
565 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  29.38 
 
 
605 aa  199  1e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  27.59 
 
 
585 aa  198  2e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2671  sulfate transporter  34.87 
 
 
736 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.183061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  29.33 
 
 
572 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  30.31 
 
 
592 aa  197  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>