More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3479 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3479  guanine deaminase  100 
 
 		 461 aa  949    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4260  guanine deaminase  67.76 
 
 		 425 aa  601  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0456  guanine deaminase  63.32 
 
 		 434 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0354  guanine deaminase  62.44 
 
 		 434 aa  557  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0370  guanine deaminase  62.44 
 
 		 434 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4625  guanine deaminase  61.97 
 
 		 447 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4494  guanine deaminase  60.47 
 
 		 435 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0638874  normal  0.0636141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3142  guanine deaminase  60 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3326  guanine deaminase  60.32 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2870  guanine deaminase  60.75 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2838  guanine deaminase  60.19 
 
 		 434 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2754  guanine deaminase  52.22 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.481519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22260  guanine deaminase  53.01 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.119985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4281  guanine deaminase  51.28 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1587  guanine deaminase  51.04 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3607  guanine deaminase  50.58 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01787  hypothetical protein  50.12 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3845  guanine deaminase  51.04 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1794  guanine deaminase  49.07 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1905  guanine deaminase  49.76 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3812  guanine deaminase  49.77 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44770  guanine deaminase  49.77 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.828703  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2771  guanine deaminase  52.24 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.888774  normal  0.860518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1807  guanine deaminase  50.35 
 
 		 446 aa  415  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1896  guanine deaminase  50.47 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0545  guanine deaminase  50.24 
 
 		 428 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2684  guanine deaminase  50 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.573349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02716  guanine deaminase  47.88 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3663  guanine aminohydrolase  46.71 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02678  hypothetical protein  47.88 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.600174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1677  guanine deaminase  47.23 
 
 		 433 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0825  guanine deaminase  47.64 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2724  guanine deaminase  48.95 
 
 		 425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3192  guanine deaminase  49.42 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.673626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3209  guanine deaminase  47.64 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3043  guanine deaminase  47.64 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0809  guanine deaminase  47.64 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1087  guanine deaminase  48.06 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0146521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1812  guanine deaminase  48.48 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00974317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3016  guanine deaminase  47.41 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1727  guanine deaminase  48.38 
 
 		 452 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2046  guanine deaminase  48.61 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177828  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4173  guanine deaminase  47.41 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4872  guanine deaminase  45.45 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.673098  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3717  guanine deaminase  49.16 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2429  guanine deaminase  47.78 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0293  guanine deaminase  48.48 
 
 		 426 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1148  amidohydrolase  49.76 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1336  guanine deaminase  50.23 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0709  guanine deaminase  48.58 
 
 		 441 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0889  guanine deaminase  47.69 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2299  guanine deaminase  48.51 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0210  guanine deaminase  48.95 
 
 		 432 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.20137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0977  guanine deaminase  47.39 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0414452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0946  guanine deaminase  47.39 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334638  normal  0.424226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01660  guanine deaminase  49.42 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000118805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2377  guanine deaminase  47.74 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.796063  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3045  guanine deaminase  46.92 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206823  normal  0.141945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0539  guanine deaminase  47.39 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1018  guanine deaminase  47.39 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4129  guanine deaminase  46.68 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2429  guanine deaminase  45.39 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1786  guanine deaminase  45.81 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0893  guanine deaminase  46.35 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0756096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0801  guanine deaminase  47 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1610  guanine deaminase  48.47 
 
 		 437 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4655  guanine deaminase  45.18 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0274988  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1143  guanine deaminase  46.1 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0881  guanine deaminase  46.59 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0166  guanine deaminase  47.88 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.301231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2918  guanine deaminase  47.88 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0463  guanine deaminase  47.88 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.451458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2609  guanine deaminase  47.88 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.694405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2978  guanine deaminase  47.88 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2250  guanine deaminase  45.28 
 
 		 444 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0981  guanine deaminase  47.88 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2099  guanine deaminase  45.52 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.716358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1926  guanine deaminase  45.28 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0907648  normal  0.0757179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3023  guanine deaminase  47.64 
 
 		 436 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3458  guanine deaminase  46.24 
 
 		 434 aa  352  7e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02520  guanine deaminase  43.41 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0081  amidohydrolase  44.13 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2623  guanine deaminase  44.73 
 
 		 454 aa  335  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3881  guanine deaminase  41.89 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1129  guanine deaminase  43.88 
 
 		 427 aa  318  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.387393  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1049  guanine deaminase  43.62 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1496  guanine deaminase  41.12 
 
 		 449 aa  316  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1336  guanine deaminase  41.89 
 
 		 432 aa  306  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.117257  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1047  guanine deaminase  43.09 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.134811  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2147  guanine deaminase  40.82 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0506  guanine deaminase  39.86 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3295  guanine deaminase  37.53 
 
 		 445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403629  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2606  guanine deaminase  40.3 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1462  guanine deaminase  38.06 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0429597  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1795  guanine deaminase  32.8 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1468  guanine deaminase  32.58 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5972  guanine deaminase  37.77 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0256  guanine deaminase  31.35 
 
 		 439 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5279  amidohydrolase  34.75 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0591  Guanine deaminase  28.18 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>