More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3374 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 491 aa  935    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 		 946 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.42 
 
 		 3427 aa  180  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.51 
 
 		 980 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  46.13 
 
 		 1534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.1 
 
 		 2954 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.19 
 
 		 526 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  47.7 
 
 		 1164 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43 
 
 		 1279 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.06 
 
 		 1795 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  41.49 
 
 		 1363 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 		 1532 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  41.49 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  44.32 
 
 		 1895 aa  159  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.72 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  40.2 
 
 		 595 aa  157  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40.98 
 
 		 460 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  43.27 
 
 		 1287 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.35 
 
 		 2105 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.54 
 
 		 3954 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.87 
 
 		 2667 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.6 
 
 		 613 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.58 
 
 		 588 aa  149  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 		 9867 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  38.44 
 
 		 341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  41.87 
 
 		 1400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.04 
 
 		 4334 aa  147  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  46.54 
 
 		 615 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  42.8 
 
 		 2145 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.52 
 
 		 833 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.07 
 
 		 1424 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 		 1855 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  49.77 
 
 		 1043 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  40.45 
 
 		 982 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.93 
 
 		 1236 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.91 
 
 		 2668 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  45.69 
 
 		 2689 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 		 363 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  38.33 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  39.8 
 
 		 965 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  41.41 
 
 		 824 aa  133  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  36.45 
 
 		 437 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  43.28 
 
 		 589 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  36.69 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  39.62 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  32.53 
 
 		 3619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  40.67 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.76 
 
 		 2678 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.81 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.35 
 
 		 1016 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.49 
 
 		 4687 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.53 
 
 		 3619 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  41.28 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  41.28 
 
 		 280 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  40.36 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  42.74 
 
 		 950 aa  122  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  42.57 
 
 		 606 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  45.59 
 
 		 1544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.52 
 
 		 795 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.96 
 
 		 757 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.65 
 
 		 5171 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  47.93 
 
 		 2775 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  38.44 
 
 		 1499 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  43.78 
 
 		 243 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  36.1 
 
 		 1079 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.51 
 
 		 1156 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  38.49 
 
 		 4800 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  45.09 
 
 		 327 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  39.93 
 
 		 561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.65 
 
 		 1883 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.05 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  49.08 
 
 		 260 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  46.29 
 
 		 245 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  42.62 
 
 		 361 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44.86 
 
 		 813 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  42.62 
 
 		 361 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  44.72 
 
 		 2885 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.65 
 
 		 1712 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  48.98 
 
 		 219 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 		 589 aa  113  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  36.15 
 
 		 769 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.93 
 
 		 1963 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  43.65 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  42.2 
 
 		 3608 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  45.1 
 
 		 850 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  46.06 
 
 		 709 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.16 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  41.22 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2816  hemolysin-type calcium-binding region  39.59 
 
 		 351 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  34.18 
 
 		 959 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  42.16 
 
 		 257 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  41.35 
 
 		 686 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  40.93 
 
 		 741 aa  106  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  40.38 
 
 		 734 aa  106  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  38.38 
 
 		 639 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  45.21 
 
 		 232 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.46 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 		 724 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  42.44 
 
 		 1884 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  43.17 
 
 		 744 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>