More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3218 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  100 
 
 		 355 aa  739    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  67.51 
 
 		 355 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  67.63 
 
 		 358 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  65.54 
 
 		 364 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  62.14 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  50.96 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  50.42 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  50.43 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  48.42 
 
 		 364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  43.18 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  43.18 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  43.3 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.75 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.66 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.66 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.94 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.94 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  42.66 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  42.94 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.94 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  44.16 
 
 		 379 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.74 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.58 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.26 
 
 		 386 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  42.82 
 
 		 381 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  42.82 
 
 		 380 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.75 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  43.38 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  42.3 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.9 
 
 		 390 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.3 
 
 		 366 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  42.54 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  42.54 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  42.54 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  42.54 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  42.09 
 
 		 382 aa  288  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  43.06 
 
 		 366 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  42.61 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  43.38 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  41.16 
 
 		 418 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.29 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.74 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  41.62 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  40.52 
 
 		 379 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.25 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.8 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.29 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.71 
 
 		 375 aa  255  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.82 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.8 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  40.63 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.57 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.88 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.31 
 
 		 376 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.92 
 
 		 380 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.41 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.41 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.02 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.51 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.49 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.62 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  34.9 
 
 		 606 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  34.9 
 
 		 606 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  33.82 
 
 		 365 aa  208  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.72 
 
 		 367 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.01 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.24 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  34.77 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  32.17 
 
 		 627 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.23 
 
 		 403 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.96 
 
 		 669 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  32.95 
 
 		 625 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  31.33 
 
 		 662 aa  169  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.47 
 
 		 605 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  30.77 
 
 		 585 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.57 
 
 		 585 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.19 
 
 		 688 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.7 
 
 		 345 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30.12 
 
 		 605 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  30.7 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.34 
 
 		 677 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  29.38 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  31.61 
 
 		 358 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  32.23 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  32.49 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4710  ferredoxin  31.49 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4796  ferredoxin  31.49 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  30.14 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5095  ferredoxin  31.49 
 
 		 350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.276207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.65 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.07 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.65 
 
 		 670 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  31.41 
 
 		 356 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.4 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  29.86 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.71 
 
 		 354 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  29.82 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.96 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.571859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>