More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3207 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  61.9 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  58.2 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  61.98 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  57.38 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  57.38 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  61.16 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  60.33 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  55.46 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  54.62 
 
 		 121 aa  130  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  46.28 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  45.45 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2707  response regulator receiver protein  53.78 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  43.97 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  45.9 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  42.98 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  43.8 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  43.8 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  45.38 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  43.7 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  45.45 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  45.45 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  45.38 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  48 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  45.22 
 
 		 120 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3302  chemotaxis response regulator, CheY4  45.45 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  51.33 
 
 		 125 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1975  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3298  hypothetical protein  44.63 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.765394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  45.22 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3973  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.249812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3466  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3451  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.390224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4035  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.52498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4294  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4072  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  45.45 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4506  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  50 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  46.09 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  46.09 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  44.07 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4831  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  41.8 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3587  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.794363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  47.06 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  48.67 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  48.21 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 120 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 120 aa  96.7  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3466  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.12169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  38.14 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>