More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3064 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3064  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  100 
 
 
180 aa  370  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.591367  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3089  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  81.67 
 
 
180 aa  294  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242629  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3900  molybdopterin binding domain-containing protein  77.22 
 
 
180 aa  263  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1246  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  66.1 
 
 
185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0268  molybdopterin binding domain-containing protein  66.1 
 
 
182 aa  238  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2805  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  64.41 
 
 
179 aa  237  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.777834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0713  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  65.34 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5418  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  67.05 
 
 
181 aa  227  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6073  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  64.77 
 
 
181 aa  222  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0940  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  62.01 
 
 
182 aa  221  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2334  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  64.77 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1202  molybdenum cofactor biosynthesis protein  62.01 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1075  molybdopterin binding protein  63.69 
 
 
182 aa  217  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0705  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  62.21 
 
 
180 aa  217  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.104213  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2601  molybdopterin biosynthesis protein B  60.89 
 
 
187 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3678  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  63.79 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.555886  normal  0.427303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0936  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  63.95 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  63.37 
 
 
185 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0995  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.89 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3223  molybdopterin binding domain-containing protein  60.34 
 
 
187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0520  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  59.78 
 
 
183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696711  normal  0.303865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0564  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  58.1 
 
 
183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266076  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1220  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.89 
 
 
182 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0455  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  60.34 
 
 
180 aa  209  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.445831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2156  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  56.8 
 
 
172 aa  202  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.934291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1778  molybdopterin binding domain-containing protein  57.8 
 
 
175 aa  197  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.21967  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4097  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  64.46 
 
 
175 aa  193  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203087  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6457  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  54.22 
 
 
212 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4792  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  53.42 
 
 
174 aa  183  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000262709  hitchhiker  0.000000182116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2689  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.69 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158705  normal  0.178292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0059  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  54.49 
 
 
184 aa  180  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0728283  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1744  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.06 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4635  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  50.9 
 
 
180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14120  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.06 
 
 
185 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0711  molybdopterin binding domain-containing protein  55.06 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1182  molybdenum cofactor biosynthesis protein  59.3 
 
 
174 aa  177  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131676  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3961  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  55.06 
 
 
179 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0088  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  51.9 
 
 
176 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151206  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3525  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  52.2 
 
 
178 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4401  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  51.9 
 
 
174 aa  175  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109195  hitchhiker  0.00152144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1138  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  51.83 
 
 
179 aa  175  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.728668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24900  molybdopterin biosynthetic protein B2  53.8 
 
 
179 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2714  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  46.06 
 
 
171 aa  174  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.393929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2129  molybdopterin biosynthetic protein B2  53.8 
 
 
179 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0612  molybdenum cofactor biosynthesis protein  50 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  53.16 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2150  molybdopterin biosynthetic protein B2  52.53 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1754  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  56.71 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3619  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  53.16 
 
 
179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1193  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  52.1 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0789398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1663  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  52.53 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.474566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13260  MoaB1  52.1 
 
 
185 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.205864  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0218  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.5 
 
 
175 aa  170  9e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1639  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  51.9 
 
 
179 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2158  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.77 
 
 
181 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0821287  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2653  molybdopterin binding domain-containing protein  50.31 
 
 
165 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2821  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.62 
 
 
180 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.689591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3217  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.62 
 
 
180 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1321  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  49.07 
 
 
170 aa  168  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.389564  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002955  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.17 
 
 
170 aa  167  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02953  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  48.17 
 
 
170 aa  167  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2281  molybdopterin binding domain-containing protein  50.31 
 
 
177 aa  167  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4119  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  45.78 
 
 
174 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0545  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.56 
 
 
170 aa  167  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1911  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  53.8 
 
 
172 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04550  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  46.71 
 
 
172 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3908  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.19 
 
 
179 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0845  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  49.4 
 
 
170 aa  164  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.245412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3855  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  46.75 
 
 
189 aa  164  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2860  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.8 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554552  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.8 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32721  normal  0.0116866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0836  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.8 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.439171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2570  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.8 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000231482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0805  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.8 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000677242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0930  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  48.8 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2352  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  51.9 
 
 
179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4600  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  49.08 
 
 
172 aa  163  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4129  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.65 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1289  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  49.08 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1314  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.2 
 
 
180 aa  162  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.186786  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2170  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  45.66 
 
 
171 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.932861  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0480  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  50 
 
 
190 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.606146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2136  molybdenum cofactor biosynthesis protein  51.27 
 
 
179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386786  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00749  molybdopterin biosynthesis protein B  48.19 
 
 
170 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00766  hypothetical protein  48.19 
 
 
170 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0952  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.59 
 
 
170 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0897  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.59 
 
 
170 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0838  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.59 
 
 
170 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.59 
 
 
170 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.757758  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0866  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  47.59 
 
 
170 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.43182  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2011  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  49.42 
 
 
173 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01047  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  46.5 
 
 
168 aa  157  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.3558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1274  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  46.39 
 
 
170 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0565702  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2525  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  43.98 
 
 
170 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2358  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  45 
 
 
169 aa  154  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.668196  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1919  molybdopterin binding protein  49.4 
 
 
174 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.954333  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03860  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  44.19 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1513  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  41.57 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2951  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  40.96 
 
 
172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2434  molybdenum cofactor biosynthesis protein B  42.77 
 
 
170 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>