More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3012 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  72.96 
 
 		 285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  68.03 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  68.28 
 
 		 268 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  68.03 
 
 		 268 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  68.05 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  68.93 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  63.12 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  61.98 
 
 		 279 aa  342  5e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  61.98 
 
 		 276 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  64.06 
 
 		 292 aa  339  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  63.22 
 
 		 288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  62.45 
 
 		 288 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  62.74 
 
 		 299 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  64.12 
 
 		 283 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  54.1 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  52.78 
 
 		 297 aa  299  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  54.28 
 
 		 292 aa  294  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  55.16 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  56.54 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  51.94 
 
 		 299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  55.09 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  52.2 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  50.19 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  53.73 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  54.22 
 
 		 299 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  47.13 
 
 		 288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  49.41 
 
 		 287 aa  258  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  47.71 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  50.2 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  43.69 
 
 		 291 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  47.12 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  47.62 
 
 		 287 aa  251  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  47.64 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  42.96 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  47.51 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  48 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  47.98 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.07 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  46.39 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  47.69 
 
 		 289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  46.92 
 
 		 318 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  50.21 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  47.58 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  50.41 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  48.58 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  46.54 
 
 		 315 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  46.54 
 
 		 292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  46.54 
 
 		 292 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  47.43 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  41.86 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  46.15 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  43.73 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  41.39 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  43.13 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  46.5 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  45.27 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  43.48 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  49.4 
 
 		 175 aa  178  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  57.25 
 
 		 147 aa  172  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  47.06 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  39.74 
 
 		 229 aa  158  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  41.71 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  38.52 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  47.9 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  40.89 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  46.88 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  40.27 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  41.15 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  37.3 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  44.69 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  44.95 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  39.47 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  44.31 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  39.47 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  50.7 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  49.32 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  38.5 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  39.55 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.82 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  52.99 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.89 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  43.79 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  46.88 
 
 		 263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  39.13 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  38.33 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  39.39 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  40.28 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  45.86 
 
 		 220 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35.66 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  39.66 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  37.82 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  38.06 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  47.92 
 
 		 216 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  41.01 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  36.4 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>