118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2901 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.525619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3499  SAM-dependent methyltransferase  58.94 
 
 		 289 aa  289  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2634  hypothetical protein  62.36 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0294  hypothetical protein  56.15 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2584  SAM-dependent methyltransferase  56.46 
 
 		 279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1196  SAM-dependent methyltransferase  60.15 
 
 		 270 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2857  SAM-dependent methyltransferase  59.39 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2677  methyltransferase type 11  47.19 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1136  methyltransferase type 11  46.34 
 
 		 298 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577473  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0481  methyltransferase  45.16 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1027  methyltransferase type 11  43.94 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1879  hypothetical protein  44.6 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1809  hypothetical protein  44.6 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0522  methyltransferase  50.2 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.255454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  43.2 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3824  putative methyltransferase protein  41.84 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1710  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281828  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3007  methyltransferase type 11  44.1 
 
 		 292 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3533  putative methyltransferase protein  41.38 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4813  methyltransferase type 11  45.49 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000890432 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0386  methyltransferase  43.93 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.559124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2968  Methyltransferase type 11  53.14 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2511  hypothetical protein  42.12 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0309  methyltransferase type 11  46.18 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.407914 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0353  Methyltransferase type 11  46.18 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.373427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0599  Methyltransferase type 11  48.16 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.586839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0109  methyltransferase type 11  50.2 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0385  Methyltransferase type 11  46.32 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.576997  normal  0.849001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  49.04 
 
 		 304 aa  188  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7593  hypothetical protein  44.62 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0028  hypothetical protein  47.97 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2265  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3971  methyltransferase  40.69 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0366  hypothetical protein  37.85 
 
 		 296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0736  hypothetical protein  47.5 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.3398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0125  Methyltransferase type 11  45 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.478416  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0560  methyltransferase type 11  37.6 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  34.76 
 
 		 376 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58842  predicted protein  35.78 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.040839  decreased coverage  0.00802664 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01100  conserved hypothetical protein  37.43 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89745  predicted protein  40.91 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.588911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1494  methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  34.56 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0725  hypothetical protein  32.57 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1791  methyltransferase type 12  34.09 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0339  hypothetical protein  30.64 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0668  hypothetical protein  36.76 
 
 		 240 aa  89  8e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  34.83 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2109  hypothetical protein  30.37 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0900704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  35.9 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  32.26 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  32.95 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  33.33 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1400  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  31.75 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  31.52 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  32.18 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.82 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.17 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.17 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2904  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2766  methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.39 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2235  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2849  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2860  methyltransferase type 11  32.49 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607715 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  31.82 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0424  hypothetical protein  30.96 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  28.98 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0876  biotin synthesis protein BioC  29.94 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2862  biotin synthesis protein BioC  30 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3539  biotin synthesis protein BioC  30 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.662235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3183  biotin synthesis protein BioC  34.19 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  27.13 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  32.79 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0454  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1243  biotin synthesis protein BioC  29.75 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1187  hypothetical protein  25.59 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1672  biotin synthesis protein BioC  29.09 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.724893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3817  biotin synthesis protein BioC  28.74 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0670  hypothetical protein  29.36 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0172  hypothetical protein  29.36 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1420  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0487  putative biotin biosynthesis protein BioC  29.36 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0505  putative biotin biosynthesis protein BioC  29.36 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2847  hypothetical protein  29.36 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3908  biotin synthesis protein BioC  25.48 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  26.9 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1679  hypothetical protein  35.85 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  27.61 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  27.22 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0360  putative biotin synthesis protein (methyltransferase)  29.1 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>